RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.1■■■□□ 2.41
PMS1-211ENST00000424766 ZFYVE9O95405 1425 aa30.09■■■□□ 2.41
PMS1-211ENST00000424766 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.09■■■□□ 2.41
PMS1-211ENST00000424766 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PMS1-211ENST00000424766 MED14O60244 1454 aa30.07■■■□□ 2.4
PMS1-211ENST00000424766 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.07■■■□□ 2.4
PMS1-211ENST00000424766 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.07■■■□□ 2.4
PMS1-211ENST00000424766 RGL3Q3MIN7 710 aa30.03■■■□□ 2.4
PMS1-211ENST00000424766 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PMS1-211ENST00000424766 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.01■■■□□ 2.39
PMS1-211ENST00000424766 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PMS1-211ENST00000424766 IQGAP1P46940 1657 aa29.98■■■□□ 2.39
PMS1-211ENST00000424766 PPLO60437 1756 aa29.98■■■□□ 2.39
PMS1-211ENST00000424766 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PMS1-211ENST00000424766 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.96■■■□□ 2.39
PMS1-211ENST00000424766 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.95■■■□□ 2.39
PMS1-211ENST00000424766 IFT172Q9UG01 1749 aa29.94■■■□□ 2.38
PMS1-211ENST00000424766 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.91■■■□□ 2.38
PMS1-211ENST00000424766 BCANQ96GW7 911 aa29.9■■■□□ 2.38
PMS1-211ENST00000424766 STAC3Q96MF2 364 aa29.9■■■□□ 2.38
PMS1-211ENST00000424766 NEUROD1Q13562 356 aa29.89■■■□□ 2.38
PMS1-211ENST00000424766 TBX22Q9Y458 520 aa29.85■■■□□ 2.37
PMS1-211ENST00000424766 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
PMS1-211ENST00000424766 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.84■■■□□ 2.37
PMS1-211ENST00000424766 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.84■■■□□ 2.37
PMS1-211ENST00000424766 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.84■■■□□ 2.37
PMS1-211ENST00000424766 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.83■■■□□ 2.37
PMS1-211ENST00000424766 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
PMS1-211ENST00000424766 MYOM2P54296 1465 aa29.81■■■□□ 2.36
PMS1-211ENST00000424766 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.81■■■□□ 2.36
PMS1-211ENST00000424766 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.81■■■□□ 2.36
PMS1-211ENST00000424766 DIP2AQ14689 1571 aa29.81■■■□□ 2.36
PMS1-211ENST00000424766 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.79■■■□□ 2.36
PMS1-211ENST00000424766 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.77■■■□□ 2.36
PMS1-211ENST00000424766 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.77■■■□□ 2.36
PMS1-211ENST00000424766 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
PMS1-211ENST00000424766 PIK3C2GO75747 1445 aa29.74■■■□□ 2.35
PMS1-211ENST00000424766 ALKQ9UM73 1620 aa29.74■■■□□ 2.35
PMS1-211ENST00000424766 PIK3R4Q99570 1358 aa29.73■■■□□ 2.35
PMS1-211ENST00000424766 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
PMS1-211ENST00000424766 TONSLQ96HA7 1378 aa29.7■■■□□ 2.35
PMS1-211ENST00000424766 KCNA6P17658 529 aa29.7■■■□□ 2.35
PMS1-211ENST00000424766 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PMS1-211ENST00000424766 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
PMS1-211ENST00000424766 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.68■■■□□ 2.34
PMS1-211ENST00000424766 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.68■■■□□ 2.34
PMS1-211ENST00000424766 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.67■■■□□ 2.34
PMS1-211ENST00000424766 METP08581 1390 aa29.66■■■□□ 2.34
PMS1-211ENST00000424766 LAMC1P11047 1609 aa29.66■■■□□ 2.34
PMS1-211ENST00000424766 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.64■■■□□ 2.34
PMS1-211ENST00000424766 CPS1P31327 1500 aa29.64■■■□□ 2.34
PMS1-211ENST00000424766 NWD1Q149M9 1564 aa29.63■■■□□ 2.33
PMS1-211ENST00000424766 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.62■■■□□ 2.33
PMS1-211ENST00000424766 PTPRUQ92729 1446 aa29.62■■■□□ 2.33
PMS1-211ENST00000424766 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.61■■■□□ 2.33
PMS1-211ENST00000424766 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.59■■■□□ 2.33
PMS1-211ENST00000424766 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PMS1-211ENST00000424766 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PMS1-211ENST00000424766 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.56■■■□□ 2.32
PMS1-211ENST00000424766 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PMS1-211ENST00000424766 CERKQ8TCT0 537 aa29.54■■■□□ 2.32
PMS1-211ENST00000424766 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.54■■■□□ 2.32
PMS1-211ENST00000424766 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.53■■■□□ 2.32
PMS1-211ENST00000424766 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PMS1-211ENST00000424766 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.51■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 ABCC11Q96J66 1382 aa29.51■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 ADGRB1O14514 1584 aa29.5■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.49■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.48■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 STK26Q9P289 416 aa29.48■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.47■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 TECPR2O15040 1411 aa29.46■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.46■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.46■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 SIRT1Q96EB6 747 aa29.46■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 TMEM94Q12767 1356 aa29.45■■■□□ 2.31
PMS1-211ENST00000424766 PTCH1Q13635 1447 aa29.45■■■□□ 2.3
PMS1-211ENST00000424766 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.42■■■□□ 2.3
PMS1-211ENST00000424766 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PMS1-211ENST00000424766 DLC1Q96QB1 1528 aa29.4■■■□□ 2.3
PMS1-211ENST00000424766 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.38■■■□□ 2.29
PMS1-211ENST00000424766 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.38■■■□□ 2.29
PMS1-211ENST00000424766 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PMS1-211ENST00000424766 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.36■■■□□ 2.29
PMS1-211ENST00000424766 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.35■■■□□ 2.29
PMS1-211ENST00000424766 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.35■■■□□ 2.29
PMS1-211ENST00000424766 C14orf37Q86TY3 774 aa29.34■■■□□ 2.29
PMS1-211ENST00000424766 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.34■■■□□ 2.29
PMS1-211ENST00000424766 MSH6P52701 1360 aa29.32■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 PRAM1Q96QH2 718 aa29.31■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 POGKQ9P215 609 aa29.31■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.29■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.29■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.29■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.28■■■□□ 2.28
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