RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417295.6

SH3GL1-202, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3GL1, Length 1,404 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-202ENST00000417295 HRCP23327 699 aa42.43■■■■■ 4.38
SH3GL1-202ENST00000417295 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
SH3GL1-202ENST00000417295 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
SH3GL1-202ENST00000417295 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.38
SH3GL1-202ENST00000417295 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.38
SH3GL1-202ENST00000417295 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.37■■■■■ 4.37
SH3GL1-202ENST00000417295 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
SH3GL1-202ENST00000417295 SLC26A8Q96RN1 970 aa42.35■■■■■ 4.37
SH3GL1-202ENST00000417295 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.33■■■■■ 4.37
SH3GL1-202ENST00000417295 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
SH3GL1-202ENST00000417295 BCANQ96GW7 911 aa42.32■■■■■ 4.37
SH3GL1-202ENST00000417295 FBXO41Q8TF61 875 aa42.29■■■■■ 4.36
SH3GL1-202ENST00000417295 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.28■■■■■ 4.36
SH3GL1-202ENST00000417295 CPS1P31327 1500 aa42.24■■■■■ 4.35
SH3GL1-202ENST00000417295 KIF1BO60333 1816 aa42.21■■■■■ 4.35
SH3GL1-202ENST00000417295 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.19■■■■■ 4.34
SH3GL1-202ENST00000417295 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.17■■■■■ 4.34
SH3GL1-202ENST00000417295 STRCP1A6NGW2 1772 aa42.17■■■■■ 4.34
SH3GL1-202ENST00000417295 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.17■■■■■ 4.34
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SH3GL1-202ENST00000417295 TBX22Q9Y458 520 aa42.15■■■■■ 4.34
SH3GL1-202ENST00000417295 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa42.13■■■■■ 4.33
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SH3GL1-202ENST00000417295 RGL3Q3MIN7 710 aa42.12■■■■■ 4.33
SH3GL1-202ENST00000417295 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa42.11■■■■■ 4.33
SH3GL1-202ENST00000417295 LRRC7Q96NW7 1537 aa42.09■■■■■ 4.33
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SH3GL1-202ENST00000417295 DIP2AQ14689 1571 aa42.01■■■■■ 4.32
SH3GL1-202ENST00000417295 NWD1Q149M9 1564 aa41.97■■■■■ 4.31
SH3GL1-202ENST00000417295 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.96■■■■■ 4.31
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SH3GL1-202ENST00000417295 METP08581 1390 aa41.92■■■■■ 4.3
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SH3GL1-202ENST00000417295 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
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SH3GL1-202ENST00000417295 PIK3C2GO75747 1445 aa41.74■■■■■ 4.27
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SH3GL1-202ENST00000417295 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
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SH3GL1-202ENST00000417295 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.67■■■■■ 4.26
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SH3GL1-202ENST00000417295 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.6■■■■■ 4.25
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SH3GL1-202ENST00000417295 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.57■■■■■ 4.25
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SH3GL1-202ENST00000417295 STK26Q9P289 416 aa41.54■■■■■ 4.24
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SH3GL1-202ENST00000417295 ABCC11Q96J66 1382 aa41.47■■■■■ 4.23
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SH3GL1-202ENST00000417295 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.46■■■■■ 4.23
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SH3GL1-202ENST00000417295 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.35■■■■■ 4.21
SH3GL1-202ENST00000417295 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.31■■■■■ 4.2
SH3GL1-202ENST00000417295 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.31■■■■■ 4.2
SH3GL1-202ENST00000417295 SIRT1Q96EB6 747 aa41.3■■■■■ 4.2
SH3GL1-202ENST00000417295 MST1RQ04912 1400 aa41.28■■■■■ 4.2
SH3GL1-202ENST00000417295 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.27■■■■■ 4.2
SH3GL1-202ENST00000417295 PRAM1Q96QH2 718 aa41.25■■■■■ 4.19
SH3GL1-202ENST00000417295 BRINP3Q76B58 766 aa41.22■■■■■ 4.19
SH3GL1-202ENST00000417295 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.21■■■■■ 4.19
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