RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXD1Q16676 465 aa25.71■■□□□ 1.71
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQGAP1P46940 1657 aa25.7■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.69■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLTCL1P53675 1640 aa25.68■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOCS7O14512 581 aa25.68■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZFYVE9O95405 1425 aa25.68■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.67■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.64■■□□□ 1.7
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPS1P31327 1500 aa25.63■■□□□ 1.69
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.61■■□□□ 1.69
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCANQ96GW7 911 aa25.6■■□□□ 1.69
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.59■■□□□ 1.69
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF1BO60333 1816 aa25.55■■□□□ 1.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.54■■□□□ 1.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.52■■□□□ 1.68
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.51■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALKQ9UM73 1620 aa25.51■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.49■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.48■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.47■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOM1O60784 492 aa25.47■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPA1LP34931 641 aa25.46■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBX22Q9Y458 520 aa25.46■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIP2AQ14689 1571 aa25.46■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.46■■□□□ 1.67
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGL3Q3MIN7 710 aa25.45■■□□□ 1.66
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.44■■□□□ 1.66
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNA6P17658 529 aa25.42■■□□□ 1.66
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIP4K2BP78356 416 aa25.41■■□□□ 1.66
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.4■■□□□ 1.66
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIK3R4Q99570 1358 aa25.4■■□□□ 1.66
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NWD1Q149M9 1564 aa25.39■■□□□ 1.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.37■■□□□ 1.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPLO60437 1756 aa25.37■■□□□ 1.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.32■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 METP08581 1390 aa25.31■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM94Q12767 1356 aa25.31■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFT172Q9UG01 1749 aa25.3■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYOM2P54296 1465 aa25.29■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.28■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPRUQ92729 1446 aa25.28■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIK3C2GO75747 1445 aa25.27■■□□□ 1.64
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.23■■□□□ 1.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.23■■□□□ 1.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.22■■□□□ 1.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAC3Q96MF2 364 aa25.22■■□□□ 1.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.2■■□□□ 1.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSH6P52701 1360 aa25.19■■□□□ 1.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.19■■□□□ 1.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C14orf37Q86TY3 774 aa25.18■■□□□ 1.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTCH1Q13635 1447 aa25.16■■□□□ 1.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.15■■□□□ 1.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.15■■□□□ 1.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAMC1P11047 1609 aa25.15■■□□□ 1.62
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.13■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.12■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEUROD1Q13562 356 aa25.12■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.11■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.1■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.1■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.1■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STK26Q9P289 416 aa25.09■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TECPR2O15040 1411 aa25.09■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC11Q96J66 1382 aa25.07■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATF3P18847 181 aa25.07■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.07■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCCP43146 1447 aa25.06■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.06■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.05■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRB1O14514 1584 aa25.02■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLAIN2Q9P270 581 aa25.02■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.02■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TONSLQ96HA7 1378 aa24.99■■□□□ 1.59
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.99■■□□□ 1.59
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIRT1Q96EB6 747 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms