RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396914.3

CHCHD4-202, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-202ENST00000396914 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
CHCHD4-202ENST00000396914 RIMS2Q9UQ26 1411 aa43.1■■■■■ 4.49
CHCHD4-202ENST00000396914 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
CHCHD4-202ENST00000396914 BCANQ96GW7 911 aa43.06■■■■■ 4.48
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
CHCHD4-202ENST00000396914 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
CHCHD4-202ENST00000396914 MED14O60244 1454 aa43.04■■■■■ 4.48
CHCHD4-202ENST00000396914 IQGAP1P46940 1657 aa43.03■■■■■ 4.48
CHCHD4-202ENST00000396914 ZFYVE9O95405 1425 aa43.03■■■■■ 4.48
CHCHD4-202ENST00000396914 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.03■■■■■ 4.48
CHCHD4-202ENST00000396914 RGL3Q3MIN7 710 aa42.99■■■■■ 4.47
CHCHD4-202ENST00000396914 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.89■■■■■ 4.46
CHCHD4-202ENST00000396914 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
CHCHD4-202ENST00000396914 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa42.88■■■■■ 4.45
CHCHD4-202ENST00000396914 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.87■■■■■ 4.45
CHCHD4-202ENST00000396914 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa42.87■■■■■ 4.45
CHCHD4-202ENST00000396914 SLC26A8Q96RN1 970 aa42.87■■■■■ 4.45
CHCHD4-202ENST00000396914 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
CHCHD4-202ENST00000396914 VGFO15240 615 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
CHCHD4-202ENST00000396914 PPLO60437 1756 aa42.77■■■■■ 4.44
CHCHD4-202ENST00000396914 NEUROD1Q13562 356 aa42.68■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 SIN3AQ96ST3 1273 aa42.67■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 TBX22Q9Y458 520 aa42.67■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 IFT172Q9UG01 1749 aa42.66■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.66■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.66■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa42.65■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa42.64■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 DIP2AQ14689 1571 aa42.63■■■■■ 4.42
CHCHD4-202ENST00000396914 CERKQ8TCT0 537 aa42.62■■■■■ 4.41
CHCHD4-202ENST00000396914 DCAF11Q8TEB1 546 aa42.62■■■■■ 4.41
CHCHD4-202ENST00000396914 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa42.62■■■■■ 4.41
CHCHD4-202ENST00000396914 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa42.61■■■■■ 4.41
CHCHD4-202ENST00000396914 CPS1P31327 1500 aa42.57■■■■■ 4.41
CHCHD4-202ENST00000396914 KCNA6P17658 529 aa42.56■■■■■ 4.4
CHCHD4-202ENST00000396914 STRCP1A6NGW2 1772 aa42.56■■■■■ 4.4
CHCHD4-202ENST00000396914 MYOM2P54296 1465 aa42.52■■■■■ 4.4
CHCHD4-202ENST00000396914 ALKQ9UM73 1620 aa42.5■■■■■ 4.39
CHCHD4-202ENST00000396914 METP08581 1390 aa42.49■■■■■ 4.39
CHCHD4-202ENST00000396914 PIK3R4Q99570 1358 aa42.49■■■■■ 4.39
CHCHD4-202ENST00000396914 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
CHCHD4-202ENST00000396914 PIK3C2GO75747 1445 aa42.47■■■■■ 4.39
CHCHD4-202ENST00000396914 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
CHCHD4-202ENST00000396914 STAC3Q96MF2 364 aa42.45■■■■■ 4.39
CHCHD4-202ENST00000396914 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa42.45■■■■■ 4.39
CHCHD4-202ENST00000396914 NWD1Q149M9 1564 aa42.44■■■■■ 4.38
CHCHD4-202ENST00000396914 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
CHCHD4-202ENST00000396914 LRRC7Q96NW7 1537 aa42.41■■■■■ 4.38
CHCHD4-202ENST00000396914 NRXN1Q9ULB1 1477 aa42.41■■■■■ 4.38
CHCHD4-202ENST00000396914 PTPRUQ92729 1446 aa42.41■■■■■ 4.38
CHCHD4-202ENST00000396914 L3MBTL2Q969R5 705 aa42.39■■■■■ 4.38
CHCHD4-202ENST00000396914 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
CHCHD4-202ENST00000396914 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.38
CHCHD4-202ENST00000396914 CFAP70Q5T0N1 1121 aa42.37■■■■■ 4.37
CHCHD4-202ENST00000396914 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
CHCHD4-202ENST00000396914 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
CHCHD4-202ENST00000396914 TMEM132EQ6IEE7 984 aa42.34■■■■■ 4.37
CHCHD4-202ENST00000396914 TONSLQ96HA7 1378 aa42.34■■■■■ 4.37
CHCHD4-202ENST00000396914 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.33■■■■■ 4.37
CHCHD4-202ENST00000396914 TMEM94Q12767 1356 aa42.32■■■■■ 4.37
CHCHD4-202ENST00000396914 LAMC1P11047 1609 aa42.31■■■■■ 4.36
CHCHD4-202ENST00000396914 STK26Q9P289 416 aa42.29■■■■■ 4.36
CHCHD4-202ENST00000396914 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
CHCHD4-202ENST00000396914 C14orf37Q86TY3 774 aa42.28■■■■■ 4.36
CHCHD4-202ENST00000396914 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.25■■■■■ 4.35
CHCHD4-202ENST00000396914 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
CHCHD4-202ENST00000396914 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.21■■■■■ 4.35
CHCHD4-202ENST00000396914 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa42.21■■■■■ 4.35
CHCHD4-202ENST00000396914 PRAG1Q86YV5 1406 aa42.21■■■■■ 4.35
CHCHD4-202ENST00000396914 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
CHCHD4-202ENST00000396914 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
CHCHD4-202ENST00000396914 FBXO41Q8TF61 875 aa42.17■■■■■ 4.34
CHCHD4-202ENST00000396914 MSH6P52701 1360 aa42.15■■■■■ 4.34
CHCHD4-202ENST00000396914 ROBO2Q9HCK4 1378 aa42.14■■■■■ 4.34
CHCHD4-202ENST00000396914 TOM1O60784 492 aa42.13■■■■■ 4.34
CHCHD4-202ENST00000396914 PTCH1Q13635 1447 aa42.13■■■■■ 4.33
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCC11Q96J66 1382 aa42.11■■■■■ 4.33
CHCHD4-202ENST00000396914 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa42.1■■■■■ 4.33
CHCHD4-202ENST00000396914 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
CHCHD4-202ENST00000396914 ADGRB1O14514 1584 aa42.08■■■■■ 4.33
CHCHD4-202ENST00000396914 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa42.07■■■■■ 4.33
CHCHD4-202ENST00000396914 TRAK1Q9UPV9 953 aa42.06■■■■■ 4.32
CHCHD4-202ENST00000396914 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.06■■■■■ 4.32
CHCHD4-202ENST00000396914 PIP4K2BP78356 416 aa42.05■■■■■ 4.32
CHCHD4-202ENST00000396914 TECPR2O15040 1411 aa42.05■■■■■ 4.32
CHCHD4-202ENST00000396914 NBPF1Q3BBV0 1214 aa42.04■■■■■ 4.32
CHCHD4-202ENST00000396914 WAPLQ7Z5K2 1190 aa42.04■■■■■ 4.32
CHCHD4-202ENST00000396914 C19orf44Q9H6X5 657 aa42.04■■■■■ 4.32
CHCHD4-202ENST00000396914 ATF3P18847 181 aa42.01■■■■■ 4.32
CHCHD4-202ENST00000396914 NBPF8Q3BBV2 869 aa42■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 POGKQ9P215 609 aa41.99■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 PRAM1Q96QH2 718 aa41.97■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.97■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.97■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.96■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.96■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.95■■■■■ 4.31
CHCHD4-202ENST00000396914 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
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