RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 L3MBTL2Q969R5 705 aa42.67■■■■■ 4.42
ECHS1-201ENST00000368547 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa42.67■■■■■ 4.42
ECHS1-201ENST00000368547 RIMS2Q9UQ26 1411 aa42.66■■■■■ 4.42
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP23Q9P227 1491 aa42.66■■■■■ 4.42
ECHS1-201ENST00000368547 ZFYVE9O95405 1425 aa42.65■■■■■ 4.42
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA2P54652 639 aa42.63■■■■■ 4.41
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF11Q8TEB1 546 aa42.63■■■■■ 4.41
ECHS1-201ENST00000368547 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
ECHS1-201ENST00000368547 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa42.58■■■■■ 4.41
ECHS1-201ENST00000368547 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa42.57■■■■■ 4.41
ECHS1-201ENST00000368547 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 LTKP29376 864 aa42.55■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 TXNDC2Q86VQ3 553 aa42.55■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.55■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 EID1Q9Y6B2 187 aa42.55■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 MYOM2P54296 1465 aa42.52■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 VGFO15240 615 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.52■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa42.48■■■■■ 4.39
ECHS1-201ENST00000368547 STAC3Q96MF2 364 aa42.48■■■■■ 4.39
ECHS1-201ENST00000368547 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
ECHS1-201ENST00000368547 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.43■■■■■ 4.38
ECHS1-201ENST00000368547 NRXN1Q9ULB1 1477 aa42.43■■■■■ 4.38
ECHS1-201ENST00000368547 STRCQ7RTU9 1775 aa42.41■■■■■ 4.38
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.39■■■■■ 4.38
ECHS1-201ENST00000368547 PIK3C2GO75747 1445 aa42.37■■■■■ 4.37
ECHS1-201ENST00000368547 PRAG1Q86YV5 1406 aa42.37■■■■■ 4.37
ECHS1-201ENST00000368547 MED14O60244 1454 aa42.36■■■■■ 4.37
ECHS1-201ENST00000368547 IQGAP1P46940 1657 aa42.35■■■■■ 4.37
ECHS1-201ENST00000368547 BCANQ96GW7 911 aa42.34■■■■■ 4.37
ECHS1-201ENST00000368547 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa42.34■■■■■ 4.37
ECHS1-201ENST00000368547 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa42.33■■■■■ 4.37
ECHS1-201ENST00000368547 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF8Q3BBV2 869 aa42.31■■■■■ 4.36
ECHS1-201ENST00000368547 ALKQ9UM73 1620 aa42.25■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.25■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 LAMC1P11047 1609 aa42.24■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa42.23■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP70Q5T0N1 1121 aa42.23■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 SLC26A8Q96RN1 970 aa42.23■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa42.22■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
ECHS1-201ENST00000368547 DIP2AQ14689 1571 aa42.19■■■■■ 4.34
ECHS1-201ENST00000368547 TBX22Q9Y458 520 aa42.14■■■■■ 4.34
ECHS1-201ENST00000368547 RALGAPBQ86X10 1494 aa42.12■■■■■ 4.33
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF1Q3BBV0 1214 aa42.11■■■■■ 4.33
ECHS1-201ENST00000368547 METP08581 1390 aa42.1■■■■■ 4.33
ECHS1-201ENST00000368547 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa42.09■■■■■ 4.33
ECHS1-201ENST00000368547 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.09■■■■■ 4.33
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM132EQ6IEE7 984 aa42.08■■■■■ 4.33
ECHS1-201ENST00000368547 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
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ECHS1-201ENST00000368547 PIK3R4Q99570 1358 aa41.99■■■■■ 4.31
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ECHS1-201ENST00000368547 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
ECHS1-201ENST00000368547 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.95■■■■■ 4.31
ECHS1-201ENST00000368547 STK26Q9P289 416 aa41.93■■■■■ 4.3
ECHS1-201ENST00000368547 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
ECHS1-201ENST00000368547 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
ECHS1-201ENST00000368547 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.9■■■■■ 4.3
ECHS1-201ENST00000368547 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.88■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 NWD1Q149M9 1564 aa41.87■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.86■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 KCNA6P17658 529 aa41.86■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.86■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC11Q96J66 1382 aa41.86■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 TECPR2O15040 1411 aa41.82■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
ECHS1-201ENST00000368547 CPS1P31327 1500 aa41.81■■■■■ 4.28
ECHS1-201ENST00000368547 DLC1Q96QB1 1528 aa41.79■■■■■ 4.28
ECHS1-201ENST00000368547 USP47Q96K76 1375 aa41.76■■■■■ 4.28
ECHS1-201ENST00000368547 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.76■■■■■ 4.28
ECHS1-201ENST00000368547 PTCH1Q13635 1447 aa41.75■■■■■ 4.27
ECHS1-201ENST00000368547 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
ECHS1-201ENST00000368547 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
ECHS1-201ENST00000368547 PRAM1Q96QH2 718 aa41.7■■■■■ 4.27
ECHS1-201ENST00000368547 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.7■■■■■ 4.27
ECHS1-201ENST00000368547 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.69■■■■■ 4.27
ECHS1-201ENST00000368547 SIRT1Q96EB6 747 aa41.69■■■■■ 4.27
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.67■■■■■ 4.26
ECHS1-201ENST00000368547 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
ECHS1-201ENST00000368547 POGKQ9P215 609 aa41.67■■■■■ 4.26
ECHS1-201ENST00000368547 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
ECHS1-201ENST00000368547 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
ECHS1-201ENST00000368547 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
ECHS1-201ENST00000368547 QRICH2Q9H0J4 1663 aa41.63■■■■■ 4.26
ECHS1-201ENST00000368547 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa41.62■■■■■ 4.25
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
ECHS1-201ENST00000368547 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.62■■■■■ 4.25
ECHS1-201ENST00000368547 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.58■■■■■ 4.25
ECHS1-201ENST00000368547 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM94Q12767 1356 aa41.56■■■■■ 4.24
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