RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 IFT172Q9UG01 1749 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 NOS1P29475 1434 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 IQGAP1P46940 1657 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 REREQ9P2R6 1566 aa25.39■■□□□ 1.66
SPNS1-204ENST00000352260 TESK2Q96S53 571 aa25.39■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 SYNMO15061 1565 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 PIK3C2BO00750 1634 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 AGLP35573 1532 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 MSH5O43196 834 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC184Q52MB2 194 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 PPLO60437 1756 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 TMF1P82094 1093 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-204ENST00000352260 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 MLECQ14165 292 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 MRS2Q9HD23 443 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 PIK3C2GO75747 1445 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 IDI1Q13907 227 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-204ENST00000352260 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 ERVK-7P63135 1459 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-204ENST00000352260 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRB1O14514 1584 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 RALBP1Q15311 655 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 CDCA8Q53HL2 280 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 PANK3Q9H999 370 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 ZFYVE9O95405 1425 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-204ENST00000352260 SLC24A1O60721 1099 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 PTPRMP28827 1452 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 MYOM1P52179 1685 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-204ENST00000352260 TMC1Q8TDI8 760 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ZMYM3Q14202 1370 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 NLRP13Q86W25 1043 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.95■■□□□ 1.59
SPNS1-204ENST00000352260 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SPNS1-204ENST00000352260 ALKQ9UM73 1620 aa24.89■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 TNRQ92752 1358 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 STK26Q9P289 416 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS1-204ENST00000352260 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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