RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.9■■■□□ 2.38
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HOXD1-201ENST00000331462 ATP7AQ04656 1500 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3C2GO75747 1445 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD1-201ENST00000331462 MS4A1P11836 297 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD1-201ENST00000331462 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
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HOXD1-201ENST00000331462 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.62■■■□□ 2.33
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HOXD1-201ENST00000331462 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.59■■■□□ 2.33
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HOXD1-201ENST00000331462 APAF1O14727 1248 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD1-201ENST00000331462 NOS1P29475 1434 aa29.44■■■□□ 2.3
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HOXD1-201ENST00000331462 ADGRB1O14514 1584 aa29.42■■■□□ 2.3
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HOXD1-201ENST00000331462 ABCC3O15438 1527 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 C8orf34Q49A92 452 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 PDE3AQ14432 1141 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
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