RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329565.5

SNN-201, Transcript of stannin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNN, Length 3,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNN-201ENST00000329565 ARID3AQ99856 593 aa23.82■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.82■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.81■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 PLA2R1Q13018 1463 aa23.81■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 ZNF521Q96K83 1311 aa23.8■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 PTPRGP23470 1445 aa23.79■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 BECN1Q14457 450 aa23.79■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.79■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
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SNN-201ENST00000329565 USP19O94966 1318 aa23.78■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.78■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.78■■□□□ 1.4
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SNN-201ENST00000329565 ATP10BO94823 1461 aa23.77■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.77■■□□□ 1.4
SNN-201ENST00000329565 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.75■■□□□ 1.39
SNN-201ENST00000329565 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.75■■□□□ 1.39
SNN-201ENST00000329565 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.74■■□□□ 1.39
SNN-201ENST00000329565 TNNQ9UQP3 1299 aa23.74■■□□□ 1.39
SNN-201ENST00000329565 IFT140Q96RY7 1462 aa23.71■■□□□ 1.39
SNN-201ENST00000329565 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.71■■□□□ 1.39
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SNN-201ENST00000329565 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SNN-201ENST00000329565 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.7■■□□□ 1.38
SNN-201ENST00000329565 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SNN-201ENST00000329565 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.69■■□□□ 1.38
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SNN-201ENST00000329565 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.67■■□□□ 1.38
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SNN-201ENST00000329565 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SNN-201ENST00000329565 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SNN-201ENST00000329565 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.64■■□□□ 1.37
SNN-201ENST00000329565 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.64■■□□□ 1.37
SNN-201ENST00000329565 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.63■■□□□ 1.37
SNN-201ENST00000329565 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.63■■□□□ 1.37
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SNN-201ENST00000329565 RLBP1P12271 317 aa23.62■■□□□ 1.37
SNN-201ENST00000329565 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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SNN-201ENST00000329565 MCM4P33991 863 aa23.61■■□□□ 1.37
SNN-201ENST00000329565 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.61■■□□□ 1.37
SNN-201ENST00000329565 ERBB4Q15303 1308 aa23.61■■□□□ 1.37
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SNN-201ENST00000329565 CDCA8Q53HL2 280 aa23.61■■□□□ 1.37
SNN-201ENST00000329565 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.61■■□□□ 1.37
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SNN-201ENST00000329565 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.6■■□□□ 1.37
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SNN-201ENST00000329565 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.56■■□□□ 1.36
SNN-201ENST00000329565 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.56■■□□□ 1.36
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SNN-201ENST00000329565 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.55■■□□□ 1.36
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SNN-201ENST00000329565 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.53■■□□□ 1.36
SNN-201ENST00000329565 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.53■■□□□ 1.36
SNN-201ENST00000329565 PIK3C2GO75747 1445 aa23.52■■□□□ 1.36
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SNN-201ENST00000329565 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.49■■□□□ 1.35
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SNN-201ENST00000329565 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.45■■□□□ 1.34
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SNN-201ENST00000329565 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SNN-201ENST00000329565 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SNN-201ENST00000329565 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SNN-201ENST00000329565 AFAP1Q8N556 730 aa23.44■■□□□ 1.34
SNN-201ENST00000329565 ERCC6Q03468 1493 aa23.43■■□□□ 1.34
SNN-201ENST00000329565 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.43■■□□□ 1.34
SNN-201ENST00000329565 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.43■■□□□ 1.34
SNN-201ENST00000329565 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SNN-201ENST00000329565 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.41■■□□□ 1.34
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