RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.8■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.8■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.8■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.79■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.79■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.79■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 PIK3C2BO00750 1634 aa22.79■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRB3O60242 1522 aa22.78■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.77■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.77■■□□□ 1.23
CHTF18-202ENST00000317063 MADDQ8WXG6 1647 aa22.76■■□□□ 1.23
CHTF18-202ENST00000317063 SLC24A1O60721 1099 aa22.76■■□□□ 1.23
CHTF18-202ENST00000317063 IFT172Q9UG01 1749 aa22.72■■□□□ 1.23
CHTF18-202ENST00000317063 PPLO60437 1756 aa22.71■■□□□ 1.23
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.7■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.7■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.69■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.69■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 STAC3Q96MF2 364 aa22.68■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.68■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.67■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.67■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.66■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 MYOM2P54296 1465 aa22.66■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 TNRQ92752 1358 aa22.66■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.65■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC7Q96M83 1385 aa22.65■■□□□ 1.22
CHTF18-202ENST00000317063 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CHTF18-202ENST00000317063 C3P01024 1663 aa22.63■■□□□ 1.21
CHTF18-202ENST00000317063 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.61■■□□□ 1.21
CHTF18-202ENST00000317063 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.61■■□□□ 1.21
CHTF18-202ENST00000317063 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CHTF18-202ENST00000317063 PIK3C2GO75747 1445 aa22.6■■□□□ 1.21
CHTF18-202ENST00000317063 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.6■■□□□ 1.21
CHTF18-202ENST00000317063 TESK2Q96S53 571 aa22.59■■□□□ 1.21
CHTF18-202ENST00000317063 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 STK26Q9P289 416 aa22.56■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.55■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 LAMC1P11047 1609 aa22.55■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.54■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.53■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 IQGAP1P46940 1657 aa22.53■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 BCANQ96GW7 911 aa22.52■■□□□ 1.2
CHTF18-202ENST00000317063 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.49■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 LTKP29376 864 aa22.49■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 ZFYVE9O95405 1425 aa22.49■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.48■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRB1O14514 1584 aa22.48■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.48■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 TMF1P82094 1093 aa22.47■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 ANP32CO43423 234 aa22.46■■□□□ 1.19
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.45■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.44■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 NLRP1Q9C000 1473 aa22.44■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 ALKQ9UM73 1620 aa22.43■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.43■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.42■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.4■■□□□ 1.18
CHTF18-202ENST00000317063 PTPRMP28827 1452 aa22.39■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.38■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 METP08581 1390 aa22.37■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 PRAM1Q96QH2 718 aa22.37■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 EID1Q9Y6B2 187 aa22.36■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.36■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.35■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 PANK3Q9H999 370 aa22.35■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 POGKQ9P215 609 aa22.34■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CHTF18-202ENST00000317063 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.33■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC184Q52MB2 194 aa22.29■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.29■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 CABP2Q9NPB3 220 aa22.29■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.28■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 CDCA8Q53HL2 280 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 TMC1Q8TDI8 760 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-202ENST00000317063 SLIT1O75093 1534 aa22.27■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.26■■□□□ 1.15
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