RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 CUL7Q14999 1698 aa7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 INSRP06213 1382 aa7.95□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 NEUROD2Q15784 382 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 DMRT2Q9Y5R5 561 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 E9PSI1 815 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 RIPK4P57078 832 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 E9PCH4 1651 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 OFD1O75665 1012 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.94□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 TESK2Q96S53 571 aa7.93□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 PRDM2Q13029 1718 aa7.93□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 NESP48681 1621 aa7.93□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 GBP4Q96PP9 640 aa7.93□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.93□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 TNNQ9UQP3 1299 aa7.93□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.92□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.92□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.92□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 RLBP1P12271 317 aa7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 AAMPQ13685 434 aa7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 UQCRHP07919 91 aa7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 MAP7D2Q96T17 732 aa7.91□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 TOPBP1Q92547 1522 aa7.9□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.9□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
LRRN3-201ENST00000308478 ERBINQ96RT1 1412 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 TSPY4P0CV99 314 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 TSPY10P0CW01 314 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 WWC1Q8IX03 1113 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.88□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 TERF1P54274 439 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 SSFA2P28290 1259 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 FGD1P98174 961 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 SMC5Q8IY18 1101 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 PTMSP20962 102 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 DDIT3P35638 169 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 WDR62O43379 1518 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 MCTP1Q6DN14 999 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 SNX21Q969T3 373 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 DYNC1I1O14576 645 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LRRN3-201ENST00000308478 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.84□□□□□ -1.16
LRRN3-201ENST00000308478 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
LRRN3-201ENST00000308478 RBSNQ9H1K0 784 aa7.83□□□□□ -1.16
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms