RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 FOXD1Q16676 465 aa37.34■■■■□ 3.57
PDF-201ENST00000288022 ZFYVE9O95405 1425 aa37.34■■■■□ 3.57
PDF-201ENST00000288022 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
PDF-201ENST00000288022 FBXO41Q8TF61 875 aa37.31■■■■□ 3.56
PDF-201ENST00000288022 BCANQ96GW7 911 aa37.31■■■■□ 3.56
PDF-201ENST00000288022 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.28■■■■□ 3.56
PDF-201ENST00000288022 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
PDF-201ENST00000288022 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
PDF-201ENST00000288022 KIF1BO60333 1816 aa37.26■■■■□ 3.56
PDF-201ENST00000288022 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
PDF-201ENST00000288022 CPS1P31327 1500 aa37.25■■■■□ 3.55
PDF-201ENST00000288022 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.23■■■■□ 3.55
PDF-201ENST00000288022 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.22■■■■□ 3.55
PDF-201ENST00000288022 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.2■■■■□ 3.55
PDF-201ENST00000288022 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.17■■■■□ 3.54
PDF-201ENST00000288022 HRCP23327 699 aa37.16■■■■□ 3.54
PDF-201ENST00000288022 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.16■■■■□ 3.54
PDF-201ENST00000288022 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.1■■■■□ 3.53
PDF-201ENST00000288022 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.05■■■■□ 3.52
PDF-201ENST00000288022 KCNA6P17658 529 aa37.04■■■■□ 3.52
PDF-201ENST00000288022 TBX22Q9Y458 520 aa37.04■■■■□ 3.52
PDF-201ENST00000288022 DIP2AQ14689 1571 aa37.03■■■■□ 3.52
PDF-201ENST00000288022 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.02■■■■□ 3.52
PDF-201ENST00000288022 UBAP1LF5GYI3 381 aa37■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 RGL3Q3MIN7 710 aa36.98■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 NWD1Q149M9 1564 aa36.97■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.97■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.96■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.95■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 PPLO60437 1756 aa36.95■■■■□ 3.51
PDF-201ENST00000288022 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
PDF-201ENST00000288022 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
PDF-201ENST00000288022 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
PDF-201ENST00000288022 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.91■■■■□ 3.5
PDF-201ENST00000288022 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
PDF-201ENST00000288022 PIK3R4Q99570 1358 aa36.9■■■■□ 3.5
PDF-201ENST00000288022 TOM1O60784 492 aa36.88■■■■□ 3.49
PDF-201ENST00000288022 TMEM94Q12767 1356 aa36.88■■■■□ 3.49
PDF-201ENST00000288022 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
PDF-201ENST00000288022 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
PDF-201ENST00000288022 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
PDF-201ENST00000288022 IFT172Q9UG01 1749 aa36.83■■■■□ 3.49
PDF-201ENST00000288022 PIP4K2BP78356 416 aa36.81■■■■□ 3.48
PDF-201ENST00000288022 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.81■■■■□ 3.48
PDF-201ENST00000288022 METP08581 1390 aa36.8■■■■□ 3.48
PDF-201ENST00000288022 PTPRUQ92729 1446 aa36.8■■■■□ 3.48
PDF-201ENST00000288022 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.78■■■■□ 3.48
PDF-201ENST00000288022 ALKQ9UM73 1620 aa36.77■■■■□ 3.48
PDF-201ENST00000288022 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PDF-201ENST00000288022 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PDF-201ENST00000288022 C14orf37Q86TY3 774 aa36.72■■■■□ 3.47
PDF-201ENST00000288022 MSH6P52701 1360 aa36.7■■■■□ 3.47
PDF-201ENST00000288022 MYOM2P54296 1465 aa36.66■■■■□ 3.46
PDF-201ENST00000288022 PIK3C2GO75747 1445 aa36.66■■■■□ 3.46
PDF-201ENST00000288022 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.66■■■■□ 3.46
PDF-201ENST00000288022 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.6■■■■□ 3.45
PDF-201ENST00000288022 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.6■■■■□ 3.45
PDF-201ENST00000288022 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.59■■■■□ 3.45
PDF-201ENST00000288022 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.56■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 PTCH1Q13635 1447 aa36.54■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 LAMC1P11047 1609 aa36.53■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.53■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 ATF3P18847 181 aa36.52■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 HSPA1LP34931 641 aa36.52■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 STK26Q9P289 416 aa36.52■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.52■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.51■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.51■■■■□ 3.44
PDF-201ENST00000288022 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.49■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 STAC3Q96MF2 364 aa36.49■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 SLAIN2Q9P270 581 aa36.49■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.49■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.46■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.46■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.45■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.45■■■■□ 3.43
PDF-201ENST00000288022 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.44■■■■□ 3.42
PDF-201ENST00000288022 DCCP43146 1447 aa36.43■■■■□ 3.42
PDF-201ENST00000288022 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PDF-201ENST00000288022 NEUROD1Q13562 356 aa36.41■■■■□ 3.42
PDF-201ENST00000288022 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.41■■■■□ 3.42
PDF-201ENST00000288022 TECPR2O15040 1411 aa36.41■■■■□ 3.42
PDF-201ENST00000288022 ABCC11Q96J66 1382 aa36.4■■■■□ 3.42
PDF-201ENST00000288022 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.35■■■■□ 3.41
PDF-201ENST00000288022 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.35■■■■□ 3.41
PDF-201ENST00000288022 ADGRB1O14514 1584 aa36.32■■■■□ 3.4
PDF-201ENST00000288022 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.3■■■■□ 3.4
PDF-201ENST00000288022 MST1RQ04912 1400 aa36.3■■■■□ 3.4
PDF-201ENST00000288022 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.29■■■■□ 3.4
PDF-201ENST00000288022 SIRT1Q96EB6 747 aa36.26■■■■□ 3.4
PDF-201ENST00000288022 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.24■■■■□ 3.39
PDF-201ENST00000288022 PHLPP1O60346 1717 aa36.24■■■■□ 3.39
PDF-201ENST00000288022 BRINP3Q76B58 766 aa36.23■■■■□ 3.39
PDF-201ENST00000288022 PRAM1Q96QH2 718 aa36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms