RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270517.11

ECSIT-202, Transcript of ECSIT signalling integrator, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECSIT, Length 1,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSIT-202ENST00000270517 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ECSIT-202ENST00000270517 MED14O60244 1454 aa26.39■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.39■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 BCANQ96GW7 911 aa26.36■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.35■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 ZFYVE9O95405 1425 aa26.34■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
ECSIT-202ENST00000270517 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ECSIT-202ENST00000270517 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.26■■□□□ 1.79
ECSIT-202ENST00000270517 RGL3Q3MIN7 710 aa26.25■■□□□ 1.79
ECSIT-202ENST00000270517 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.25■■□□□ 1.79
ECSIT-202ENST00000270517 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.24■■□□□ 1.79
ECSIT-202ENST00000270517 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.23■■□□□ 1.79
ECSIT-202ENST00000270517 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.23■■□□□ 1.79
ECSIT-202ENST00000270517 CERKQ8TCT0 537 aa26.22■■□□□ 1.79
ECSIT-202ENST00000270517 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.18■■□□□ 1.78
ECSIT-202ENST00000270517 PPLO60437 1756 aa26.17■■□□□ 1.78
ECSIT-202ENST00000270517 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.17■■□□□ 1.78
ECSIT-202ENST00000270517 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.16■■□□□ 1.78
ECSIT-202ENST00000270517 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
ECSIT-202ENST00000270517 CPS1P31327 1500 aa26.13■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.12■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 TBX22Q9Y458 520 aa26.11■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 DIP2AQ14689 1571 aa26.11■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 IFT172Q9UG01 1749 aa26.1■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.1■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.1■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 KCNA6P17658 529 aa26.08■■□□□ 1.77
ECSIT-202ENST00000270517 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
ECSIT-202ENST00000270517 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.06■■□□□ 1.76
ECSIT-202ENST00000270517 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.03■■□□□ 1.76
ECSIT-202ENST00000270517 NWD1Q149M9 1564 aa26.02■■□□□ 1.76
ECSIT-202ENST00000270517 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ECSIT-202ENST00000270517 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.02■■□□□ 1.76
ECSIT-202ENST00000270517 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
ECSIT-202ENST00000270517 ALKQ9UM73 1620 aa26■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 PIK3R4Q99570 1358 aa26■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 DCAF11Q8TEB1 546 aa26■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 METP08581 1390 aa26■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 NEUROD1Q13562 356 aa26■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 FBXO41Q8TF61 875 aa26■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 SIN3AQ96ST3 1273 aa26■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.98■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 PTPRUQ92729 1446 aa25.98■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 MYOM2P54296 1465 aa25.97■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ECSIT-202ENST00000270517 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.95■■□□□ 1.74
ECSIT-202ENST00000270517 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ECSIT-202ENST00000270517 TMEM94Q12767 1356 aa25.95■■□□□ 1.74
ECSIT-202ENST00000270517 PIK3C2GO75747 1445 aa25.94■■□□□ 1.74
ECSIT-202ENST00000270517 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ECSIT-202ENST00000270517 C14orf37Q86TY3 774 aa25.91■■□□□ 1.74
ECSIT-202ENST00000270517 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.9■■□□□ 1.74
ECSIT-202ENST00000270517 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.89■■□□□ 1.74
ECSIT-202ENST00000270517 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.88■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 TOM1O60784 492 aa25.87■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 STK26Q9P289 416 aa25.87■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 STAC3Q96MF2 364 aa25.86■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 LAMC1P11047 1609 aa25.86■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 PIP4K2BP78356 416 aa25.85■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.84■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 MSH6P52701 1360 aa25.83■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.83■■□□□ 1.73
ECSIT-202ENST00000270517 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ECSIT-202ENST00000270517 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.79■■□□□ 1.72
ECSIT-202ENST00000270517 PTCH1Q13635 1447 aa25.78■■□□□ 1.72
ECSIT-202ENST00000270517 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ECSIT-202ENST00000270517 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.78■■□□□ 1.72
ECSIT-202ENST00000270517 TONSLQ96HA7 1378 aa25.76■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.75■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.75■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.75■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 ATF3P18847 181 aa25.74■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 ABCC11Q96J66 1382 aa25.73■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.72■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.72■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 ADGRB1O14514 1584 aa25.71■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 TECPR2O15040 1411 aa25.71■■□□□ 1.71
ECSIT-202ENST00000270517 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.7■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.7■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.69■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.69■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.67■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 SLAIN2Q9P270 581 aa25.67■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.66■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 POGKQ9P215 609 aa25.66■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.66■■□□□ 1.7
ECSIT-202ENST00000270517 PRAM1Q96QH2 718 aa25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.3 ms