RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.06■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 FSD2A1L4K1 749 aa21.05■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.05■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.05■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 TRAK2O60296 914 aa21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 COG6Q9Y2V7 657 aa21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 ERBB4Q15303 1308 aa21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 PTPRGP23470 1445 aa21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.04■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 ESPNB1AK53 854 aa21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 PANK1Q8TE04 598 aa21.03■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.02■□□□□ 0.96
AFG3L2-201ENST00000269143 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 PREX2Q70Z35 1606 aa21.01■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 SLFN5Q08AF3 891 aa20.99■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 MRE11P49959 708 aa20.99■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.99■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.99■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.98■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 PLEKHG5O94827 1062 aa20.97■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 APAF1O14727 1248 aa20.97■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.97■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.96■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.96■□□□□ 0.95
AFG3L2-201ENST00000269143 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.95■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 SHROOM2Q13796 1616 aa20.95■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 E9PCH4 1651 aa20.95■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 CHD1O14646 1710 aa20.95■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 PPP2R1AP30153 589 aa20.94■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.93■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 ARID3AQ99856 593 aa20.92■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.92■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF521Q96K83 1311 aa20.92■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.91■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.91■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.9■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 NEUROD2Q15784 382 aa20.9■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.9■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 NLRP1Q9C000 1473 aa20.9■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.9■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.89■□□□□ 0.94
AFG3L2-201ENST00000269143 TESK2Q96S53 571 aa20.89■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 TMF1P82094 1093 aa20.89■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.88■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.88■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 UNC13BO14795 1591 aa20.88■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.88■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.87■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 TNNQ9UQP3 1299 aa20.87■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.86■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.86■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.86■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.85■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.84■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.83■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 TPM2P07951 284 aa20.83■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 INSRP06213 1382 aa20.83■□□□□ 0.93
AFG3L2-201ENST00000269143 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.82■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 PLA2R1Q13018 1463 aa20.82■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 PLXNC1O60486 1568 aa20.82■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 E9PSI1 815 aa20.82■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.82■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.81■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 PDE3AQ14432 1141 aa20.81■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 ERBINQ96RT1 1412 aa20.81■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 HSCBQ8IWL3 235 aa20.8■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.8■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.79■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 RLBP1P12271 317 aa20.79■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.78■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.78■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 ABCC2Q92887 1545 aa20.78■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.77■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.77■□□□□ 0.92
AFG3L2-201ENST00000269143 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.75■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.75■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 LAMC1P11047 1609 aa20.75■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 A2MP01023 1474 aa20.73■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
AFG3L2-201ENST00000269143 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms