RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264263.9

GFM1-201, Transcript of G elongation factor mitochondrial 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GFM1, Length 3,453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFM1-201ENST00000264263 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.68□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.67□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.66□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 KIF14Q15058 1648 aa14.66□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.66□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 CDCA8Q53HL2 280 aa14.65□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.65□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.65□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 WWC1Q8IX03 1113 aa14.65□□□□□ -0.06
GFM1-201ENST00000264263 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.65□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 DISP1Q96F81 1524 aa14.64□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 USP19O94966 1318 aa14.63□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.63□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.63□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.63□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 AFAP1Q8N556 730 aa14.62□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.62□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.62□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.62□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.61□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 TRAK2O60296 914 aa14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 LNPKQ9C0E8 428 aa14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 MTHFSP49914 203 aa14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 HSCBQ8IWL3 235 aa14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.6□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.59□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 KIF3BO15066 747 aa14.59□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 A2MP01023 1474 aa14.59□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 MCM4P33991 863 aa14.58□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.58□□□□□ -0.07
GFM1-201ENST00000264263 APBB1O00213 710 aa14.57□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.57□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 PDE3AQ14432 1141 aa14.57□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 STK26Q9P289 416 aa14.57□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 ZNF521Q96K83 1311 aa14.56□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.56□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 KIAA0556O60303 1618 aa14.55□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.55□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.54□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 PTPRGP23470 1445 aa14.54□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 ATP10BO94823 1461 aa14.53□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.53□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 CFAP53Q96M91 514 aa14.53□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.53□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 GRIN2AQ12879 1464 aa14.53□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.52□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 RUNDC1Q96C34 613 aa14.52□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.52□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.52□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 ADAMTS12P58397 1594 aa14.52□□□□□ -0.08
GFM1-201ENST00000264263 ERCC6Q03468 1493 aa14.52□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 PLA2R1Q13018 1463 aa14.52□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.51□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 ADGRL2O95490 1459 aa14.51□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 GGT6Q6P531 493 aa14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 ESPNB1AK53 854 aa14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 FBLN1P23142 703 aa14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 PLEKHG5O94827 1062 aa14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.49□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.49□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.49□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 CABP2Q9NPB3 220 aa14.49□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.48□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.48□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.47□□□□□ -0.09
GFM1-201ENST00000264263 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156 ms