RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.24■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 CFTRP13569 1480 aa24.24■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 NUCB2P80303 420 aa24.23■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 EVC2Q86UK5 1308 aa24.23■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 PPP2R1AP30153 589 aa24.23■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.23■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 MCTP1Q6DN14 999 aa24.22■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.22■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 TPM4P67936 248 aa24.21■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.21■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TTYH3-201ENST00000258796 BCAR3O75815 825 aa24.2■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 PDE3AQ14432 1141 aa24.19■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.18■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.18■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.18■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.17■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 TIAM1Q13009 1591 aa24.17■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
TTYH3-201ENST00000258796 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.13■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.12■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 AMPHP49418 695 aa24.1■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 MTHFSP49914 203 aa24.1■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 CDC45O75419 566 aa24.1■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 BECN2A8MW95 431 aa24.09■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 STAC3Q96MF2 364 aa24.09■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 NUTM2FA1L443 756 aa24.09■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 SKAP1Q86WV1 359 aa24.09■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 RNF214Q8ND24 703 aa24.09■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 KIF3AQ9Y496 699 aa24.09■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.08■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 PTPRGP23470 1445 aa24.08■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TTYH3-201ENST00000258796 H3BQV1 296 aa24.08■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 IFFO2Q5TF58 517 aa24.08■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 COG3Q96JB2 828 aa24.07■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.07■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 NAIPQ13075 1403 aa24.07■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF592Q92610 1267 aa24.07■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.07■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 GORABQ5T7V8 394 aa24.06■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 46.2
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 GNAI1P63096 354 aa24.04■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 TPM2P07951 284 aa24.04■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.04■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.04■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 MCM4P33991 863 aa24.03■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.02■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.02■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 ROCK1Q13464 1354 aa24.02■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 MAP7D2Q96T17 732 aa24.02■■□□□ 1.44
TTYH3-201ENST00000258796 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 TOP2BQ02880 1626 aa24.01■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.01■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 HMOX1P09601 288 aa24■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 RUFY2Q8WXA3 655 aa24■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.99■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.99■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.99■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.98■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 ESPNB1AK53 854 aa23.97■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.97■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 NECTIN2Q92692 538 aa23.96■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 BICD2Q8TD16 824 aa23.96■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 NCAPD3P42695 1498 aa23.96■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.96■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 MBD3O95983 291 aa23.95■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
TTYH3-201ENST00000258796 RABEP1Q15276 862 aa23.95■■□□□ 1.42
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.94■■□□□ 1.42
TTYH3-201ENST00000258796 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
TTYH3-201ENST00000258796 NPHP1O15259 732 aa23.94■■□□□ 1.42
TTYH3-201ENST00000258796 SLFN5Q08AF3 891 aa23.94■■□□□ 1.42
TTYH3-201ENST00000258796 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.94■■□□□ 1.42
TTYH3-201ENST00000258796 NEK4P51957 841 aa23.94■■□□□ 1.42
TTYH3-201ENST00000258796 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.93■■□□□ 1.42
TTYH3-201ENST00000258796 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms