RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa32.26■■■□□ 2.76
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tulp4Q9JIL5 1547 aa32.24■■■□□ 2.75
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Polr3aB2RXC6 1390 aa32.22■■■□□ 2.75
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mug2P28666 1451 aa32.22■■■□□ 2.75
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dapk1Q80YE7 1442 aa32.11■■■□□ 2.73
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fan1Q69ZT1 1020 aa31.88■■■□□ 2.69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rock2P70336 1388 aa31.87■■■□□ 2.69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm13695A2AK44 830 aa31.85■■■□□ 2.69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P3h3Q8CG70 732 aa31.84■■■□□ 2.69
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Txndc2Q6P902 515 aa31.83■■■□□ 2.69
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Psme1P97371 249 aa31.76■■■□□ 2.68
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Setd1aE9PYH6 1716 aa31.75■■■□□ 2.67
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q9D9H8 365 aa31.72■■■□□ 2.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa31.7■■■□□ 2.67
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrrc7Q80TE7 1490 aa31.69■■■□□ 2.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zbtb4Q5F293 982 aa31.69■■■□□ 2.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Srcin1Q9QWI6 1250 aa31.69■■■□□ 2.66
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nphp4P59240 1425 aa31.68■■■□□ 2.66
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dip2aQ8BWT5 1523 aa31.64■■■□□ 2.66
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pola1P33609 1465 aa31.59■■■□□ 2.65
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slit3Q9WVB4 1523 aa31.59■■■□□ 2.65
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stag3O70576 1240 aa31.54■■■□□ 2.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 IqubQ8CDK3 788 aa31.54■■■□□ 2.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa31.53■■■□□ 2.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ift172Q6VH22 1749 aa31.53■■■□□ 2.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Exoc6Q8R313 802 aa31.52■■■□□ 2.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa31.52■■■□□ 2.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa31.52■■■□□ 2.64
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
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Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
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