RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kif21aQ9QXL2 1672 aa7.31□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 WizO88286 1684 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fmnl2A2APV2 1086 aa7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plekhd1B2RPU2 505 aa7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sh3bp5Q9Z131 463 aa7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc27Q3V036 639 aa7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atp6v1dP57746 247 aa7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 HypkQ9CR41 129 aa7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Swt1Q9DBQ9 907 aa7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zeb2Q9R0G7 1215 aa7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm156Q58A37 223 aa7.29□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trim44Q9QXA7 346 aa7.29□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plin1Q8CGN5 517 aa7.29□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa7.29□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 AI481877A2ALV5 1481 aa7.29□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 TkfcQ8VC30 578 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ddx11Q6AXC6 880 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 MecomP14404 1042 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fchsd2Q3USJ8 740 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Abcc1O35379 1528 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bcl11aQ9QYE3 773 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Casc1Q6TDU8 730 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Wdr7Q920I9 1489 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trim58Q5NCC9 485 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tceal9Q9DD24 104 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Shroom2A2ALU4 1481 aa7.28□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pla2r1Q62028 1487 aa7.27□□□□□ -1.24
Herc1-201ENSMUST00000042824 CrbnQ8C7D2 445 aa7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 PsapQ61207 557 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cavin4A2AMM0 362 aa7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 R3hcc1Q8BSI6 488 aa7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zpr1Q62384 459 aa7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Samd9lQ69Z37 1561 aa7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Peg3Q3URU2 1571 aa7.27□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm973E9Q295 1059 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rassf8Q8CJ96 419 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp644E9QA22 1323 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atl3Q91YH5 541 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kcnh5Q920E3 988 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Polr3aB2RXC6 1390 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rusc2Q80U22 1514 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc60Q8C4J0 545 aa7.26□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Erich3F6QRE9 1637 aa7.25□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plcd4Q8K3R3 807 aa7.25□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Chmp3Q9CQ10 224 aa7.25□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 NexnQ7TPW1 607 aa7.25□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyb5rlB1AS42 316 aa7.25□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q8BT18 775 aa7.25□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bcl11bQ99PV8 884 aa7.25□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adam1bQ8R534 806 aa7.24□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tnnt1O88346 262 aa7.24□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cdk19Q8BWD8 501 aa7.24□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ipo8Q7TMY7 1010 aa7.24□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cetn4Q8K4K1 168 aa7.24□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hap1O35668 628 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 PtmaP26350 111 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plcb2A3KGF7 1181 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pip4k2bQ80XI4 416 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Supt16hQ920B9 1047 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Iffo2Q8R2V2 512 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kdm5bQ80Y84 1544 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 UvssaQ9D479 717 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pik3c2gO70167 1506 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dennd6aQ8BH65 605 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc30Q8BVF4 654 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plekhh1Q80TI1 1356 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mcm2P97310 904 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dnai1Q8C0M8 701 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cers3Q1A3B0 383 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Evi5lH3BKQ3 813 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cplx2P84086 134 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa7.22□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 BC005561E9Q5E2 1589 aa7.21□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slx4Q6P1D7 1565 aa7.21□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Talpid3E9PV87 1520 aa7.21□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sos1Q62245 1319 aa7.21□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ncoa3O09000 1398 aa7.21□□□□□ -1.25
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hoxb7P09024 217 aa7.21□□□□□ -1.26
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa7.21□□□□□ -1.26
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa7.21□□□□□ -1.26
Herc1-201ENSMUST00000042824 TefQ9JLC6 301 aa7.21□□□□□ -1.26
Herc1-201ENSMUST00000042824 PxdnQ3UQ28 1475 aa7.21□□□□□ -1.26
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