RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ddrgk1Q80WW9 315 aa18.68■□□□□ 0.58
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sycp1Q62209 993 aa18.67■□□□□ 0.58
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Hmox1P14901 289 aa18.67■□□□□ 0.58
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rsph3aQ3UFY4 516 aa18.67■□□□□ 0.58
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ipo4Q8VI75 1082 aa18.66■□□□□ 0.58
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nol12Q8BG17 217 aa18.65■□□□□ 0.58
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Casq1O09165 405 aa18.63■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sugp2Q8CH09 1067 aa18.63■□□□□ 0.57
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Shroom4Q1W617 1475 aa18.63■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ttll5Q8CHB8 1328 aa18.63■□□□□ 0.57
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Stk3Q9JI10 497 aa18.62■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rsph6aQ8CDR2 708 aa18.62■□□□□ 0.57
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm10471E9Q1C7 252 aa18.61■□□□□ 0.57
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Me1P06801 572 aa18.6■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 KinQ8K339 391 aa18.59■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 NexnQ7TPW1 607 aa18.59■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Kdm4aQ8BW72 1064 aa18.59■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Commd10Q8JZY2 202 aa18.59■□□□□ 0.57
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Evi5lH3BKQ3 813 aa18.58■□□□□ 0.57
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa18.58■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ppp4r3bQ922R5 820 aa18.57■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ush1cQ9ES64 910 aa18.57■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Map7d2A2AG50 781 aa18.57■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Esx1O88933 382 aa18.57■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cux2P70298 1426 aa18.56■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rnf20Q5DTM8 973 aa18.56■□□□□ 0.56
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa18.56■□□□□ 0.56
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccnb3Q810T2 1396 aa18.55■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Usp48Q3V0C5 1052 aa18.55■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Usp47Q8BY87 1376 aa18.54■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PogkQ80TC5 607 aa18.54■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 UvssaQ9D479 717 aa18.53■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Kcnn1Q9EQR3 537 aa18.53■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Hook1Q8BIL5 728 aa18.53■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa18.52■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cep89Q9CZX2 791 aa18.52■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pdcl3Q8BVF2 240 aa18.52■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Podxl2Q8CAE9 603 aa18.52■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 TatQ8QZR1 454 aa18.52■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fbln2P37889 1221 aa18.52■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa18.52■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmc1Q8R4P5 757 aa18.52■□□□□ 0.56
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cdca7Q9D0M2 382 aa18.52■□□□□ 0.56
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa18.52■□□□□ 0.55
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rufy1Q8BIJ7 712 aa18.52■□□□□ 0.55
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cnnm1Q0GA42 951 aa18.5■□□□□ 0.55
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 ArsiQ32KI9 573 aa18.5■□□□□ 0.55
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ell2Q3UKU1 639 aa18.5■□□□□ 0.55
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc34Q3UI66 367 aa18.49■□□□□ 0.55
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sv2bQ8BG39 683 aa18.49■□□□□ 0.55
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa18.49■□□□□ 0.55
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Agtpbp1Q641K1 1218 aa18.49■□□□□ 0.55
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Babam1Q3UI43 333 aa18.49■□□□□ 0.55
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Q9D9H8 365 aa18.48■□□□□ 0.55
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Kif4P33174 1231 aa18.48■□□□□ 0.55
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MyzapQ3UIJ9 466 aa18.48■□□□□ 0.55
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