Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
Kdm4aQ8BW72 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Kdm4aQ8BW72 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Kdm4aQ8BW72 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Kdm4aQ8BW72 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Kdm4aQ8BW72 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm4aQ8BW72 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Kdm4aQ8BW72 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm4aQ8BW72 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Kdm4aQ8BW72 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Kdm4aQ8BW72 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm4aQ8BW72 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm4aQ8BW72 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Kdm4aQ8BW72 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm4aQ8BW72 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm4aQ8BW72 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kdm4aQ8BW72 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm4aQ8BW72 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm4aQ8BW72 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm4aQ8BW72 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm4aQ8BW72 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm4aQ8BW72 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm4aQ8BW72 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm4aQ8BW72 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm4aQ8BW72 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm4aQ8BW72 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Kdm4aQ8BW72 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm4aQ8BW72 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Kdm4aQ8BW72 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Kdm4aQ8BW72 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Kdm4aQ8BW72 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm4aQ8BW72 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm4aQ8BW72 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm4aQ8BW72 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Kdm4aQ8BW72 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm4aQ8BW72 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm4aQ8BW72 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm4aQ8BW72 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm4aQ8BW72 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm4aQ8BW72 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm4aQ8BW72 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm4aQ8BW72 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm4aQ8BW72 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm4aQ8BW72 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Kdm4aQ8BW72 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm4aQ8BW72 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm4aQ8BW72 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm4aQ8BW72 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm4aQ8BW72 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm4aQ8BW72 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm4aQ8BW72 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm4aQ8BW72 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm4aQ8BW72 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm4aQ8BW72 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm4aQ8BW72 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm4aQ8BW72 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Kdm4aQ8BW72 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm4aQ8BW72 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm4aQ8BW72 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm4aQ8BW72 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm4aQ8BW72 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm4aQ8BW72 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm4aQ8BW72 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm4aQ8BW72 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm4aQ8BW72 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm4aQ8BW72 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm4aQ8BW72 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm4aQ8BW72 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm4aQ8BW72 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm4aQ8BW72 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm4aQ8BW72 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm4aQ8BW72 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm4aQ8BW72 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm4aQ8BW72 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm4aQ8BW72 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm4aQ8BW72 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm4aQ8BW72 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm4aQ8BW72 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm4aQ8BW72 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdm4aQ8BW72 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kdm4aQ8BW72 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm4aQ8BW72 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kdm4aQ8BW72 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm4aQ8BW72 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm4aQ8BW72 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Kdm4aQ8BW72 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm4aQ8BW72 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm4aQ8BW72 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Kdm4aQ8BW72 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kdm4aQ8BW72 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kdm4aQ8BW72 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm4aQ8BW72 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm4aQ8BW72 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm4aQ8BW72 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm4aQ8BW72 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm4aQ8BW72 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm4aQ8BW72 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms