RNA–Protein interactions for RNA: YOL084W

PHM7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene PHM7, Length 2,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHM7	YOL084W	SWD3	P38123	315 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	XPT1	P47165	209 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	FRE8	Q12209	686 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SPS2	P08459	502 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YHL044W	P38727	235 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SYM1	Q06563	197 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
PHM7	YOL084W	ATG40	Q99325	256 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PET20	Q99373	253 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PRM5	P40476	318 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MSE1	P48525	536 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	RSM27	P53305	110 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PRM15	Q03262	622 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	LIP2	Q06005	328 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	GEP5	Q12393	293 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	RPB7	P34087	171 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MIA40	P36046	403 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MRPL3	P36516	390 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	GPI18	P38211	433 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YBR242W	P38331	238 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SOL1	P50278	321 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YNR064C	P53750	290 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YML018C	Q03730	393 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SEN2	P16658	377 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	ACH1	P32316	526 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PIR5	P46999	287 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	GIM3	P53900	129 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	NRG1	Q03125	231 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	ATG22	P25568	528 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MRPL22	P53881	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	FIT1	Q04433	528 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	ECM18	Q04623	453 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	VAM3	Q12241	283 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MED4	Q12343	284 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	UBA3	Q99344	299 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	CPR5	P35176	225 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	ABM1	P47146	123 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	OKP1	P53298	406 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	HSK3	P69852	69 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	CSI2	Q08054	341 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	RFM1	Q12192	310 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	IES6	P32617	166 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PAC2	P39937	518 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	BMT5	P40493	336 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YHC3	P47040	408 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SCP1	Q08873	200 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	RDI1	Q12434	202 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	VMA11	P32842	164 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	POP8	P38208	133 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	POP2	P39008	433 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	DGK1	Q12382	290 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	ATP10	P18496	279 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	YFL015C	P43578	164 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	VBA1	Q04301	562 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	SOR2	Q07786	357 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	BBP1	Q12365	385 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	TRM13	Q12383	476 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PUT1	P09368	476 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	CKA1	P15790	372 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	MRP20	P32387	263 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHM7	YOL084W	PPQ1	P32945	549 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 154.5 ms