RNA–Protein interactions for RNA: YLR466W

YRF1-4, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-4, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-4	YLR466W	COQ2	P32378	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	GPI16	P38875	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FLX1	P40464	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SIP18	P50263	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PCP1	P53259	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	HEM4	P06174	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YER121W	P40076	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	GMC1	Q04399	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SAG1	P20840	650 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FAT1	P38225	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YBR292C	P38357	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PAC2	P39937	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YEA6	P39953	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PRY1	P47032	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YNR066C	P53752	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YIL077C	P40508	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YNR040W	P53736	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	UPS1	Q05776	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	GRC3	Q07845	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	WHI5	Q12416	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MSI1	P13712	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YBR220C	P38318	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YJR056C	P47115	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	HHT1	P61830	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FIT1	Q04433	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FYV7	Q12247	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MNS1	P32906	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YUH1	P35127	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PCL7	P40186	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YDL183C	P48569	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YDC1	Q02896	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PEX4	P29340	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YEA4	P40004	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	TIM10	P87108	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FIT3	Q08907	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	RNH203	Q12338	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	INN1	P53901	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SWT1	Q12104	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	LSB5	P25369	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	IMP1	P28627	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PGD1	P40356	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	APJ1	P53940	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	ODC1	Q03028	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	EDS1	P38073	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	POG1	P40473	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PEF1	P53238	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CRZ1	P53968	678 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SKO1	Q02100	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MRPS5	P33759	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PEX7	P39108	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	HXT14	P42833	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YJR012C	P47087	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CWC27	Q02770	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	RIM9	Q04734	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	WTM2	Q12206	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CNB1	P25296	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	GWT1	P47026	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	ERG25	P53045	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	WSC3	Q12215	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MAK32	P23060	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	RPB7	P34087	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YKL107W	P34251	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YER084W	P40057	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	RTS2	P40962	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	COX16	P47081	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	TMA23	Q03525	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	LPP1	Q04396	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	ERV1	P27882	189 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SPC29	P33419	253 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	IKI1	P38874	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.5 ms