RNA–Protein interactions for RNA: YLR018C

POM34, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeastyeast

Gene POM34, Length 900 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34YLR018C HUG1Q6Q5K6 68 aa8.34□□□□□ -1.07
POM34YLR018C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa8.34□□□□□ -1.07
POM34YLR018C MAG1P22134 296 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YPC1P38298 316 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SSO2P39926 295 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C CWC25P53854 179 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C MRPL22P53881 309 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YOR029WQ12243 111 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa8.33□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YGL015CP33199 130 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data8.32□□□□□ -1.08not detected
POM34YLR018C IRC24P40580 263 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PIR5P46999 287 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C RRT7Q07829 113 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YCT1Q12235 531 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C TFC7Q12415 435 aa8.32□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SEC22P22214 214 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ERG2P32352 222 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PHM8P40025 321 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PRM5P40476 318 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C XPT1P47165 209 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YGL262WP53054 175 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C JAC1P53193 184 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C VPS28Q02767 242 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ASM4Q05166 528 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YDL086WQ07505 273 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YFH1Q07540 174 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SNA4Q07549 140 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YOR292CQ08743 309 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C NUM1Q00402 2748 aa8.31□□□□□ -1.08
POM34YLR018C CUE1P38428 203 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C GEP4P38812 185 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PCL7P40186 285 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SBH2P52871 88 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C GEP7P53171 287 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C WSC3Q12215 556 aa8.3□□□□□ -1.08
POM34YLR018C REC104P33323 182 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SWM2P40342 146 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YHC3P47040 408 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C TAD2P47058 250 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C INN1P53901 409 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C DGK1Q12382 290 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YBL029C-AQ3E756 94 aa8.29□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ATP10P18496 279 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C COQ2P32378 372 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C PDC2P32896 925 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C ERV15P38312 142 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YIL012WP40551 113 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C TTI2P47168 421 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C SMM1P53720 384 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YNR064CP53750 290 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C WSC2P53832 503 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YDL009CQ12210 107 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C RTR2Q12378 196 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa8.28□□□□□ -1.08
POM34YLR018C CPR5P35176 225 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YHL044WP38727 235 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C IKI1P38874 309 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C NCA3P46955 337 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YJR012CP47087 207 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C PNC1P53184 216 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ORM1P53224 222 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C DID2P69771 204 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ANT1Q06497 328 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C IRC25Q07951 179 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YOL029CQ08187 201 aa8.27□□□□□ -1.09
POM34YLR018C GDH1P07262 454 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C MRS4P23500 304 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C LSB5P25369 354 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YFL015CP43578 164 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C PKP2P53170 491 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C GPI15P53961 229 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ACT1P60010 375 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ECM18Q04623 453 aa8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ISC10P32645 267 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C SIT1P39980 628 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YIR020CP40575 100 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C PAM18Q07914 168 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C FMP16Q12497 93 aa8.25□□□□□ -1.09
POM34YLR018C APA2P22108 325 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C SRY1P36007 326 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C AGX1P43567 385 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C LPP1Q04396 274 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C HRD1Q08109 551 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ATG5Q12380 294 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C SPO24Q3E752 67 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C YOS1Q3E834 85 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ISN1Q99312 450 aa8.24□□□□□ -1.09
POM34YLR018C ROX3P25046 220 aa8.23□□□□□ -1.09
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