RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data4.78□□□□□ -1.64not detected
RRP4YHR069C YIR020CP40575 100 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C LSM1P47017 172 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C GPG1P53130 126 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C SMX3P54999 86 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C ARG5,6Q01217 863 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C YPL067CQ02754 198 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C VBA1Q04301 562 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C RTR2Q12378 196 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C RDI1Q12434 202 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C YLR365WQ7LIF2 110 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C ATG40Q99325 256 aa4.78□□□□□ -1.64
RRP4YHR069C PUT1P09368 476 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C FUS3P16892 353 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C POP8P38208 133 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C POP2P39008 433 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C PRM5P40476 318 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YFL015CP43578 164 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C PIR5P46999 287 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C SOL1P50278 321 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C GEP7P53171 287 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C ALG9P53868 555 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C MRPL22P53881 309 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C FIT1Q04433 528 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C ASM4Q05166 528 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YDL086WQ07505 273 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C UBA3Q99344 299 aa4.77□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C GRX2P17695 143 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C APA2P22108 325 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C PAN3P36102 679 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C SRL3P36167 246 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C RPS0BP46654 252 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C XPT1P47165 209 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C INN1P53901 409 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C HSK3P69852 69 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C THI74Q04083 370 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YDR286CQ05530 114 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C LIP2Q06005 328 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C SCP1Q08873 200 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C RFM1Q12192 310 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C VAM3Q12241 283 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C RDL1Q12305 139 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C SCM3Q12334 223 aa4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C URA2P07259 2214 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C CKA1P15790 372 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YUH1P35127 236 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C CPR5P35176 225 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YGL262WP53054 175 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C NIF3P53081 288 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C SMM1P53720 384 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C GIM3P53900 129 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C RTT103Q05543 409 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C FEX2Q08991 375 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C MED4Q12343 284 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C TRM13Q12383 476 aa4.75□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C ARG80P07249 177 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C MRP17P28778 131 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C GPI18P38211 433 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C GZF3P42944 551 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C UBP8P50102 471 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YNR064CP53750 290 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C RIM9Q04734 239 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YOR292CQ08743 309 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C SPO24Q3E752 67 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C HUG1Q6Q5K6 68 aa4.74□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C QCR2P07257 368 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C ATP10P18496 279 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C CKS1P20486 150 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YCL042WP25572 119 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C IES6P32617 166 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C REC104P33323 182 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C CUE1P38428 203 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YHL044WP38727 235 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C PAC2P39937 518 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C BMT5P40493 336 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C CAB5Q03941 241 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C TSA2Q04120 196 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C CSI2Q08054 341 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data4.73□□□□□ -1.65not detected
RRP4YHR069C FEX1Q08913 375 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C SWT1Q12104 458 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C YDL009CQ12210 107 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C DGK1Q12382 290 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C GEP5Q12393 293 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C TFC7Q12415 435 aa4.73□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C TPI1P00942 248 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C GDH1P07262 454 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RRP4YHR069C GCN3P14741 305 aa4.72□□□□□ -1.65
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