RNA–Protein interactions for RNA: YDR243C

PRP28, Transcript of RNA helicase in the DEAD-box family, yeast

Gene PRP28, Length 1,767 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP28	YDR243C	YOS1	Q3E834	85 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YCR015C	P25616	317 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YCR099C	P25657	155 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	ASK1	P35734	292 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	THI2	P38141	450 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MOH1	P38191	138 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MPM1	P40364	252 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	HMS2	P47175	358 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MTM1	P53320	366 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	RTT102	P53330	157 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	RNH201	P53942	307 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	CRZ1	P53968	678 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	AIM34	Q03673	198 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	INM2	Q05533	292 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MCP1	Q12106	302 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	ORT1	Q12375	292 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TOA2	P32774	122 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TIR2	P33890	251 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YKL102C	P34249	101 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	GEX2	P36173	615 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TRS20	P38334	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	PSD1	P39006	500 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YER076C	P40049	302 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YFL054C	P43549	646 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	ATG27	P46989	271 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MSY1	P48527	492 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	SCS3	P53012	380 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	EST3	Q03096	181 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YPR114W	Q06107	315 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	DCI1	Q08558	271 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YPL260W	Q08977	551 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MCT1	Q12283	360 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MYO1	P08964	1928 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	ADK2	P26364	225 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	CWP1	P28319	239 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	OAC1	P32332	324 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MRP49	P32388	137 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	PPZ2	P33329	710 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	SPC29	P33419	253 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YKL187C	P34231	750 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	DRE2	P36152	348 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MIX23	P38162	196 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	AXL2	P38928	823 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	SPC25	P40014	221 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	PAU5	P43575	122 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	COQ5	P49017	307 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	HHT1	P61830	136 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	THI74	Q04083	370 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	ATG33	Q06485	197 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	SUE1	Q06524	206 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	SOR2	Q07786	357 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	PRM3	Q08931	133 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	POM34	Q12445	299 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	COX19	Q3E731	98 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	COX1	P00401	534 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	INO4	P13902	151 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TFS1	P14306	219 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	STE18	P18852	110 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	COX10	P21592	462 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	GPI12	P23797	304 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	ZRT1	P32804	376 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	THI80	P35202	319 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MRPS9	P38120	278 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MIC12	P38341	106 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	TRR2	P38816	342 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YEL068C	P39977	110 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	HAC1	P41546	238 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	CAT5	P41735	233 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	CDC14	Q00684	551 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YMR166C	Q03829	368 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	KEI1	Q06346	221 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YPL247C	Q12523	523 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PRP28	YDR243C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.96	□□□□□ -1.78
PRP28	YDR243C	YCL068C	P25593	260 aa		3.96	□□□□□ -1.78
PRP28	YDR243C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78

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