RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SPS18P32572 300 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C AGA2P32781 87 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SLM4P38247 162 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SOL3P38858 249 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C AGX1P43567 385 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SKP1P52286 194 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SLI1P53304 468 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C LRS4Q04087 347 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C PEX10Q05568 337 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C RXT3Q07458 294 aa2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SUP53tL(CAA)C VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data2.72□□□□□ -1.97not detected
SUP53tL(CAA)C YLL053CP0CD98 152 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YKL063CP35725 167 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YHK8P38776 514 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YNL194CP40169 301 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YJL163CP46996 555 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C POP6P53218 158 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C HAL1Q01766 294 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YLR283WQ05867 314 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C NEJ1Q06148 342 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ATG39Q06159 398 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ASR1Q06834 288 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YPD1Q07688 167 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C PST2Q12335 198 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ORT1Q12375 292 aa2.71□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C OAC1P32332 324 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ECT1P33412 323 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MIC12P38341 106 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SIC1P38634 284 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ECM1P39715 212 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C RRG9P40156 214 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SDP1P40479 209 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C RTS2P40962 232 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C PAM16P42949 149 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C GWT1P47026 490 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MIC26P50087 233 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YNL095CP53932 642 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C COG5P53951 403 aa2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SIP1P32578 815 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C VAM7P32912 316 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SDS24P38314 527 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MST28P39552 234 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SSO2P39926 295 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MAM33P40513 266 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C EFM3P47163 339 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C HNT2P49775 206 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MST27P53176 234 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ALG13P53178 202 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C CPD1P53314 239 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MRPL13Q02204 264 aa2.69□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C PET494P07390 489 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C TFC1P32367 649 aa2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MRP20P32387 263 aa2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YBR285WP38354 144 aa2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ERG25P53045 309 aa2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C HLR1Q04429 423 aa2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YMR252CQ04814 134 aa2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data2.68□□□□□ -1.98not detected
SUP53tL(CAA)C PCL9Q12477 304 aa2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YOL159C-AQ3E769 90 aa2.68□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C UBC8P28263 218 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C OCH1P31755 480 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C AFR1P33304 620 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SPC34P36131 295 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YAR028WP39548 234 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YFL067WP43537 175 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YJR120WP47157 116 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C UBP8P50102 471 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C DSL1P53847 754 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ALG9P53868 555 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SRL4Q03085 281 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SNZ1Q03148 297 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SMP3Q04174 516 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C FMP42Q04991 504 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C OSW1Q08692 278 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YOR352WQ08816 343 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C AGC1Q12482 902 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C YJR112W-AQ3E743 109 aa2.67□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C HTB1P02293 131 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C GAL1P04385 528 aa2.66□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C CKA1P15790 372 aa2.66□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C MRPL6P32904 214 aa2.66□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C UTP30P36144 274 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C SHE1P38200 338 aa2.66□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C UMP1P38293 148 aa2.66□□□□□ -1.98
SUP53tL(CAA)C GEP4P38812 185 aa2.66□□□□□ -1.98
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