RNA–Protein interactions for RNA: YJL112W

MDV1, Transcript of Peripheral protein of cytosolic face of mitochondrial outer membrane, yeast

Gene MDV1, Length 2,145 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDV1	YJL112W	BNR1	P40450	1375 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	APS1	P35181	156 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	ARN2	P38724	620 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	PEX17	P40155	199 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	FLC3	P53121	802 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YNL046W	P53956	172 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	DID2	P69771	204 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YMR206W	Q03695	313 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	PFA4	Q12006	378 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YLR111W	Q12528	110 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	SLO1	Q3E784	85 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	HEM4	P06174	275 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	SCO1	P23833	295 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	AHC2	P25649	128 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	CTS1	P29029	562 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YMC1	P32331	307 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	GPX1	P36014	167 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	MRPL17	P36528	281 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	MBA1	P38300	278 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YBR285W	P38354	144 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YHL049C	P38722	271 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	CHL4	P38907	458 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	XBP1	P40489	647 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	FAR7	P43592	221 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YJL043W	P47053	257 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	ECL1	P48235	211 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	MRH4	P53166	561 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	CRZ1	P53968	678 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	RSC9	Q03124	581 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	RAV2	Q03956	351 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YOR186W	Q08560	144 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	AGA1	P32323	725 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	TFC1	P32367	649 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.65	□□□□□ -1.98	not detected
MDV1	YJL112W	SOL2	P37262	315 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	FCY21	P40039	528 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	PGD1	P40356	397 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	HAC1	P41546	238 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	TPC1	P53257	314 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	FMN1	Q03778	218 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	YMR317W	Q04893	1140 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	SHH4	Q06236	168 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	MSA1	Q08471	629 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	BSC1	Q12140	328 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	MDM32	Q12171	622 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	ATP14	Q12349	124 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	TFC7	Q12415	435 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	PCL9	Q12477	304 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	CSR2	Q12734	1121 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDV1	YJL112W	CYC3	P06182	269 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	FUN26	P31381	517 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	SPL2	P38839	148 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	YJR015W	P47090	510 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	CWC27	Q02770	301 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	SDH7	Q04401	133 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	MIM1	Q08176	113 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	YHR139C-A	O13536	103 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	HIS3	P06633	220 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	YCR022C	P25620	114 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	CDC50	P25656	391 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	TRS65	P32893	560 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	PMU1	P36069	295 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	MRPL39	P36533	70 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	POP4	P38336	279 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	MEP2	P41948	499 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	ILM1	P47155	203 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	NRM1	P53718	249 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	GPI17	Q04080	534 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	NKP2	Q06162	153 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	SUE1	Q06524	206 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	YOL073C	Q08232	322 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	OSW1	Q08692	278 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
MDV1	YJL112W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99

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