RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W-B

YHR213W-B, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeastyeast

Gene YHR213W-B, Length 300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR213W-BYHR213W-B YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B DIE2P50076 525 aa5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SOL1P50278 321 aa5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B TEX1P53851 422 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B DMA2P53924 522 aa5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YML018CQ03730 393 aa5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B ECM18Q04623 453 aa5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SYM1Q06563 197 aa5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B MED4Q12343 284 aa5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YLR365WQ7LIF2 110 aa5.51□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B REP2P03872 296 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B GCN3P14741 305 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B FUS3P16892 353 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B ATG22P25568 528 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B VMA8P32610 256 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B ISC10P32645 267 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B NTC20P38302 140 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B PAC2P39937 518 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.5□□□□□ -1.53not detected
YHR213W-BYHR213W-B GEP7P53171 287 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B PEF1P53238 335 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B ARG5,6Q01217 863 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B MRPL13Q02204 264 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B PRM15Q03262 622 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SCP1Q08873 200 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B UBA3Q99344 299 aa5.5□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B RAD52P06778 471 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B ARG80P07249 177 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B CKA1P15790 372 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B MIR1P23641 311 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YCR016WP25617 290 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B MRP17P28778 131 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B PPQ1P32945 549 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YUH1P35127 236 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B PAN3P36102 679 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SWD2P36104 329 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B BNA2P47125 453 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B VBA1Q04301 562 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B FRE8Q12209 686 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B PRM4Q12498 284 aa5.49□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B RPL39P04650 51 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B PUT1P09368 476 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B AGA2P32781 87 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B RPB7P34087 171 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B CPR5P35176 225 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B EDS1P38073 919 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SWD3P38123 315 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B RPA34P47006 233 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SLX9P53251 210 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B OKP1P53298 406 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SMM1P53720 384 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YNR064CP53750 290 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SNA4Q07549 140 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B VAM3Q12241 283 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YLR108CQ12259 485 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B DGK1Q12382 290 aa5.48□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B GDH1P07262 454 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YLL053CP0CD98 152 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SEN2P16658 377 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SUA5P32579 426 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SRL3P36167 246 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B POP8P38208 133 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B GPI18P38211 433 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YPC1P38298 316 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B AIM46P38885 310 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data5.47□□□□□ -1.53not detected
YHR213W-BYHR213W-B POP2P39008 433 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SLM1P40485 686 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B ABM1P47146 123 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B NIF3P53081 288 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B MRPL22P53881 309 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B CAB5Q03941 241 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B FIT1Q04433 528 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B RTT103Q05543 409 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YOL029CQ08187 201 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B YPR108W-AQ3E7B3 70 aa5.47□□□□□ -1.53
YHR213W-BYHR213W-B SAR1P20606 190 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B DIT1P21623 536 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B GAR1P28007 205 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B MRP20P32387 263 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B SOR1P35497 357 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B FIG1P38224 298 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B RRF1P38771 230 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B YIL012WP40551 113 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B HSK3P69852 69 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B MEH1Q02205 184 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B CAC2Q04199 468 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B DPB4Q04603 196 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B SOR2Q07786 357 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B Q0297Q9ZZV8 51 aa5.46□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B QCR2P07257 368 aa5.45□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B IES6P32617 166 aa5.45□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B RPL13BP40212 199 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B YIR020CP40575 100 aa5.45□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B IRC24P40580 263 aa5.45□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B NCA3P46955 337 aa5.45□□□□□ -1.54
YHR213W-BYHR213W-B TTI2P47168 421 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms