RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	AGX1	P43567	385 aa		7.15	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MEH1	Q02205	184 aa		7.15	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	VPS28	Q02767	242 aa		7.15	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YAP6	Q03935	383 aa		7.15	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YDR286C	Q05530	114 aa		7.15	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		7.15	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	LDB16	P25587	256 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	OCH1	P31755	480 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	ISC10	P32645	267 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YEA6	P39953	335 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	RPB10	P22139	70 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MCH2	P36032	473 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SHG1	P38337	142 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	GPI16	P38875	610 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	IKS1	P47042	667 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	ERV15	P38312	142 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YIL029C	P40538	142 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SOL1	P50278	321 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YCL001W-A	P87012	153 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	PIN2	Q12057	282 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SAG1	P20840	650 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MSK1	P32048	576 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	POP2	P39008	433 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	APJ1	P53940	528 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	RSM10	Q03201	203 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YDL086W	Q07505	273 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	ATP16	Q12165	160 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	PCC1	Q3E833	88 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	HBN1	Q96VH4	193 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	VMA3	P25515	160 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	EDS1	P38073	919 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	ECM31	P38122	312 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	XBP1	P40489	647 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	HNT2	P49775	206 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	RCE1	Q03530	315 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YDR391C	Q04170	232 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SEC62	P21825	274 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	COQ2	P32378	372 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MNS1	P32906	549 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	RPB7	P34087	171 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SLM1	P40485	686 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YIL024C	P40543	189 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	CAF16	P43569	289 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MRX5	P47007	382 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YNR040W	P53736	256 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YMR254C	Q04838	102 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	PIN3	Q06449	215 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YOL029C	Q08187	201 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	RIP1	P08067	215 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MSI1	P13712	422 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	MRPS5	P33759	307 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YKL162C	P36052	402 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YEA4	P40004	342 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	TSA2	Q04120	196 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YPR098C	Q06089	161 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	FRE8	Q12209	686 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	ERG2	P32352	222 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	PAC2	P39937	518 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	FLX1	P40464	311 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	YJR056C	P47115	236 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	CAF40	P53829	373 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	7.09	□□□□□ -1.27	not detected
GGA2	YHR108W	ATG40	Q99325	256 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GGA2	YHR108W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
GGA2	YHR108W	YML003W	P0CF16	290 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GGA2	YHR108W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
GGA2	YHR108W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
GGA2	YHR108W	YUH1	P35127	236 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GGA2	YHR108W	SWD3	P38123	315 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GGA2	YHR108W	MTC6	P38849	526 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GGA2	YHR108W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
GGA2	YHR108W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.2 ms