RNA–Protein interactions for RNA: YGL248W

PDE1, Transcript of Low-affinity cyclic AMP phosphodiesterase, yeast

Gene PDE1, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDE1	YGL248W	MNN5	P46982	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SOL1	P50278	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SDT1	P53078	280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SUR7	P54003	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	TMA23	Q03525	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SCS7	Q03529	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YML018C	Q03730	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	TIM18	Q08749	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	HAP2	P06774	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	PHO85	P17157	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	PCL1	P24867	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	APS1	P35181	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	PMU1	P36069	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	AIM18	P38884	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	XBP1	P40489	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	OST2	P46964	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ORC5	P50874	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	HHO1	P53551	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SLM2	P53955	656 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YAP7	Q08182	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	NAT2	P37293	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	POP8	P38208	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ARN2	P38724	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	CFD1	P40558	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YGL034C	P53186	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YGR039W	P53225	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YDR366C	P87287	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	PET191	Q02772	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	NHP10	Q03435	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	DIC1	Q06143	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	GPA2	P10823	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	CNB1	P25296	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SNC2	P33328	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YKL102C	P34249	101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	MRPL15	P36523	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	AVT5	P38176	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	GWT1	P47026	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	AIF1	P52923	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ODC1	Q03028	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	AIM36	Q03798	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	DGA1	Q08650	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	FCY1	Q12178	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	MHP1	P43638	1398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SIR2	P06700	562 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ERD2	P18414	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	MAK32	P23060	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	STP22	P25604	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SRL3	P36167	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	XPT1	P47165	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	AIM11	P87275	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	MCH1	Q07376	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	FRE8	Q12209	686 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	EAF3	Q12432	401 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	BI2	P03873	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	SEC59	P20048	519 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	ERV46	P39727	415 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	MOB1	P40484	314 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	IRC15	Q02733	499 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	SDC1	Q03323	175 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	OSW1	Q08692	278 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	PFA4	Q12006	378 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	PEX17	P40155	199 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	YPL073C	P40323	161 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	PAN6	P40459	309 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	NRM1	P53718	249 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	YNL046W	P53956	172 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	NUP100	Q02629	959 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDE1	YGL248W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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