RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	SDH7	Q04401	133 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	OSW1	Q08692	278 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YOR292C	Q08743	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PSK1	P31374	1356 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	TFC1	P32367	649 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	TVP38	P36164	337 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	NAT2	P37293	288 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SCO2	P38072	301 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MOH1	P38191	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YHL044W	P38727	235 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YER186C	P40101	306 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	GLC8	P41818	229 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MDM34	P53083	459 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MRH4	P53166	561 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YMR320W	Q04897	101 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FSH2	Q05015	223 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	LDB18	Q07887	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	ATP16	Q12165	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HMS1	Q12398	434 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PHO2	P07269	559 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MSI1	P13712	422 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YKL102C	P34249	101 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HOT13	P36078	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MIX23	P38162	196 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	POP4	P38336	279 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YJL213W	P40896	331 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SCS3	P53012	380 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YGL101W	P53144	215 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	ERV29	P53337	310 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	BOR1	P53838	576 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HHT1	P61830	136 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	DID2	P69771	204 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FMN1	Q03778	218 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	GPI17	Q04080	534 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	TSA2	Q04120	196 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	IES4	Q08561	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	DGA1	Q08650	418 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	GEP5	Q12393	293 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	CYC3	P06182	269 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	NMT1	P14743	455 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	IMP1	P28627	190 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PEX2	P32800	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FLO5	P38894	1075 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YEA4	P40004	342 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FCY21	P40039	528 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RFC2	P40348	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YIL012W	P40551	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	CAT5	P41735	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MEP2	P41948	499 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	NCA3	P46955	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SDT1	P53078	280 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YPL113C	Q02961	396 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RUB1	Q03919	77 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HRD1	Q08109	551 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YIL177C	P40434	1758 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YJL225C	P40889	1758 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	TY1B-H	O13535	1793 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RPN13	O13563	156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MRS3	P10566	314 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	UGX2	P32772	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	POP8	P38208	133 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	APQ12	P40532	138 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MNN5	P46982	586 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SDS23	P53172	527 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	AAH1	P53909	347 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	ADD37	Q03233	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YLR177W	Q06251	628 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FYV7	Q12247	151 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PDR18	P53756	1333 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	TRP1	P00912	224 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX8	YER116C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88

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