RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	MGA1	P53050	456 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YNR014W	P53719	212 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	FRE4	P53746	719 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CRZ1	P53968	678 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	FIT1	Q04433	528 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SEI1	Q06058	285 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ATG33	Q06485	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PAU23	Q07987	124 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	BTS1	Q12051	335 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PAU17	Q12370	124 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	UTR5	P32630	166 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YBL029W	P38201	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	DOG1	P38774	246 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MAF1	P41910	395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	HIT1	P46973	164 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ATG21	Q02887	496 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	AVO2	Q04749	426 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SCW10	Q04951	389 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	POS5	Q06892	414 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MCH1	Q07376	486 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	HEM25	Q07534	307 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SWT1	Q12104	458 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	FRE7	Q12333	620 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CYC3	P06182	269 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YKU70	P32807	602 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ROT2	P38138	954 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YHR177W	P38867	453 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YIL012W	P40551	113 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	UBP16	Q02863	499 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	BNA5	Q05979	453 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SWC7	Q06707	132 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
EXO1	YOR033C	YKL071W	P36086	256 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PIC2	P40035	300 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YHC3	P47040	408 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YJR015W	P47090	510 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SAY1	P53324	424 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	AAD4	Q07747	329 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	THP1	Q08231	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	FLO11	P08640	1367 aa		4.65	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PUT1	P09368	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MRP49	P32388	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	DCG1	P32460	244 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	HXT4	P32467	576 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RTC2	P38279	296 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	EMC5	P40540	141 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	FKH2	P41813	862 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	AIM25	P47140	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RTT102	P53330	157 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	INM2	Q05533	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SWM1	Q12379	170 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	INO4	P13902	151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YCR015C	P25616	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SYN8	P31377	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SFK1	P35735	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YOR062C	P36025	268 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ATG12	P38316	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YEL068C	P39977	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	HAC1	P41546	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YGR149W	P48236	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	COX18	P53239	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SUR7	P54003	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	DIC1	Q06143	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	GAS5	Q08193	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	DCI1	Q08558	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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