RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	AFG1	P32317	509 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PPZ2	P33329	710 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YKL107W	P34251	309 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	BMT5	P40493	336 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PHB2	P50085	310 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	OKP1	P53298	406 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MRPL22	P53881	309 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	RSM23	Q01163	450 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	TIM44	Q01852	431 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YML108W	Q03759	105 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YDR248C	Q03786	193 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	TGS1	Q12052	315 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	AEP3	Q12089	606 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PET20	Q99373	253 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	FMP27	Q06179	2628 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MDH2	P22133	377 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	CPR4	P25334	318 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ERG3	P32353	365 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	COS8	P38723	381 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	UME6	P39001	836 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	SSO2	P39926	295 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ECO1	P43605	281 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	TAD2	P47058	250 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	AVT4	P50944	713 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	UBC12	P52491	188 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MCT1	Q12283	360 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ISA2	Q12425	185 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	COX5B	P00425	151 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PCL1	P24867	279 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	SED4	P25365	1065 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	FMT1	P32785	401 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	VAM7	P32912	316 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	POP8	P38208	133 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MSY1	P48527	492 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YGL159W	P53110	370 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	HOL1	P53389	586 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YNR048W	P53740	393 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	CAB5	Q03941	241 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ANT1	Q06497	328 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	SCP1	Q08873	200 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	GRE1	Q08969	168 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
MIA40	YKL195W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	UBS1	P38290	277 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	YIR035C	P40579	254 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	CTK2	P46962	323 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	UBP8	P50102	471 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	MRP51	Q02950	344 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	YDR387C	Q04162	555 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	SYM1	Q06563	197 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	VAM3	Q12241	283 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	EAF3	Q12432	401 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	STE4	P18851	423 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	IFM1	P25038	676 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	PDC2	P32896	925 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	SRY1	P36007	326 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	FLO10	P36170	1169 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	YBR096W	P38256	230 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	YPC1	P38298	316 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	LAG1	P38703	411 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	NIF3	P53081	288 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	RTT103	Q05543	409 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	ATP14	Q12349	124 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	TFC7	Q12415	435 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	UBA3	Q99344	299 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	SEC22	P22214	214 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	CPR3	P25719	182 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	YND1	P40009	630 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	ATF1	P40353	525 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	MOB2	P43563	287 aa		5.69	□□□□□ -1.5
MIA40	YKL195W	YHC3	P47040	408 aa		5.69	□□□□□ -1.5

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