RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	TFC1	P32367	649 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YJR056C	P47115	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YGL159W	P53110	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	OKP1	P53298	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	RSM27	P53305	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SAY1	P53324	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YNL234W	P53857	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	MIX17	Q03667	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ATO3	Q12359	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	BBP1	Q12365	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SPS4	P09937	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SNF4	P12904	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	IMP1	P28627	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	PPZ2	P33329	710 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YND1	P40009	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	VPS55	P47111	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	COS10	P52924	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	VOA1	P53262	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	NRG1	Q03125	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SPC2	Q04969	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	HOR7	Q05827	59 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	EAF3	Q12432	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	MAM33	P40513	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	TTI2	P47168	421 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	CCC1	P47818	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ERP6	P53198	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YGR151C	P53287	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	STD1	Q02794	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ARP10	Q04549	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	KIN28	P06242	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	CDC43	P18898	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	AFG1	P32317	509 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SDH4	P37298	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	THI2	P38141	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ECM1	P39715	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	GET2	P40056	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	DLS1	P40366	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	MSC3	Q05812	728 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YLR415C	O13578	112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	ATG22	P25568	528 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	ZRT3	P34240	503 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	PMU1	P36069	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	SPC34	P36131	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	ACL4	Q03771	387 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	HOF1	Q05080	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	MDM36	Q06820	579 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	PRM3	Q08931	133 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	VAM3	Q12241	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	UTR5	P32630	166 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	CPR5	P35176	225 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	PAC2	P39937	518 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	RRG9	P40156	214 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	FAR7	P43592	221 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	SSN8	P47821	323 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	YGL262W	P53054	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	YGR016W	P53209	190 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	YLR152C	P54072	576 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	UPS1	Q05776	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	PCL9	Q12477	304 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	REP2	P03872	296 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	MRPL6	P32904	214 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	ECT1	P33412	323 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	YJL213W	P40896	331 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	MRX5	P47007	382 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	YIP1	P53039	248 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	CAB4	P53332	305 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SYF2	YGR129W	HUT1	Q12520	339 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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