RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	NAT2	P37293	288 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	YPK3	P38070	525 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	YJR056C	P47115	236 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	PHB2	P50085	310 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	SAY1	P53324	424 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	AAH1	P53909	347 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	SPC2	Q04969	178 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YNL057W	YNL057W	SOD2	P00447	233 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ERS1	P17261	260 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	PTP2	P29461	750 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YBR144C	P34215	104 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MTH1	P35198	433 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SPC34	P36131	295 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.52	□□□□□ -1.85	RIP-Chip
YNL057W	YNL057W	YND1	P40009	630 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MAM33	P40513	266 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YFL015C	P43578	164 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MIG2	P53035	382 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YGL159W	P53110	370 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YGR151C	P53287	111 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	GAL83	Q04739	417 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	LIP2	Q06005	328 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YLR173W	Q06247	608 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	FRE3	Q08905	711 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ATO3	Q12359	275 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	EAF3	Q12432	401 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	REP2	P03872	296 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SAM35	P14693	329 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	PHO80	P20052	293 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	HXT2	P23585	541 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	IMP1	P28627	190 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	OKP1	P53298	406 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RSM27	P53305	110 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YNL234W	P53857	426 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MSC3	Q05812	728 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MDM36	Q06820	579 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	GRC3	Q07845	632 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	TPK3	P05986	398 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SPS4	P09937	338 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MDM10	P18409	493 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	INO2	P26798	304 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	AFG1	P32317	509 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MTC2	P34246	357 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SIC1	P38634	284 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YAR028W	P39548	234 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	DDI1	P40087	428 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	DLS1	P40366	167 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	TTI2	P47168	421 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	COS10	P52924	374 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YGL262W	P53054	175 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ARP10	Q04549	284 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ECM18	Q04623	453 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	DAL4	Q04895	635 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SPR28	Q04921	423 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	HOF1	Q05080	669 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	HOR7	Q05827	59 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	BBP1	Q12365	385 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ADE8	P04161	214 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ENA1	P13587	1091 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	PPZ2	P33329	710 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	PMU1	P36069	295 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	GET2	P40056	285 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	RRG9	P40156	214 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SDP1	P40479	209 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YFL054C	P43549	646 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	FAR7	P43592	221 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	VPS55	P47111	140 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ENA2	Q01896	1091 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	MIX17	Q03667	156 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	SCW10	Q04951	389 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	VAM3	Q12241	283 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	JID1	Q12350	301 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	ENA5	Q12691	1091 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	LSO1	Q3E827	93 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL057W	YNL057W	UBC8	P28263	218 aa		3.48	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42 ms