RNA–Protein interactions for RNA: YLR431C

ATG23, Transcript of Peripheral membrane protein required for autophagy and CVT, yeast

Gene ATG23, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG23	YLR431C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	UTH1	P36135	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	COQ5	P49017	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	ATG5	Q12380	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	FLO11	P08640	1367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	SNA3	P14359	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	TAF14	P35189	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	TRM9	P49957	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	MGA1	P53050	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	TVP15	Q03860	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	PIN3	Q06449	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	JLP1	Q12358	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
ATG23	YLR431C	ARN2	P38724	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	BDH1	P39714	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YFL012W	P43580	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	NUP57	P48837	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YGR067C	P53243	804 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	FYV6	P53913	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	GOT1	Q03554	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	HEM25	Q07534	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YPS3	Q12303	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	CBF1	P17106	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YJR149W	P47177	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	OSH6	Q02201	448 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	QCR6	P00127	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	HTB2	P02294	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	MRPS9	P38120	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	IKI1	P38874	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	SEO1	P39709	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	ALG13	P53178	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	MRX8	Q05473	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	TPO4	Q12256	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	CPT1	P17898	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	GET1	P53192	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YNL046W	P53956	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG23	YLR431C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	BRR6	P53062	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	NIF3	P53081	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	RSM27	P53305	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	SIR4	P11978	1358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	CUP2	P15315	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	ERD2	P18414	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	PPH21	P23594	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	SUR2	P38992	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	IRC18	P47056	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	URA6	P15700	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	TEM1	P38987	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YAK1	P14680	807 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	SPL2	P38839	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	TOS8	P53147	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YGL034C	P53186	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	APA2	P22108	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YOX1	P34161	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	TRR2	P38816	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YJL028W	P47062	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	OST3	P48439	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	RAD9	P14737	1309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	QCR7	P00128	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	YER189W	P40104	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	PRR2	Q12310	699 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	TIM22	Q12328	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG23	YLR431C	IES3	Q12345	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms