RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W COS4P43542 379 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W TRM9P49957 279 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W OSH6Q02201 448 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YPL039WQ03080 316 aa3.52□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W SIR4P11978 1358 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W RPL28P02406 149 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W MATALPHA2P0CY08 210 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W HMLALPHA2P0CY09 210 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W PRE7P23724 241 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W DPB2P24482 689 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W DRE2P36152 348 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YHB1P39676 399 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W HAM1P47119 197 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W MRH4P53166 561 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YGR067CP53243 804 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W GOT1Q03554 138 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YDR124WQ04608 324 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W SEI1Q06058 285 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W PIN3Q06449 215 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YBL008W-AQ3E821 79 aa3.51□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YDR157WA0A023PZE8 133 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W BCY1P07278 416 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W CBF1P17106 351 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W CPT1P17898 393 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
YKR047WYKR047W NIF3P53081 288 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W ALG13P53178 202 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W TVP15Q03860 143 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W HEM25Q07534 307 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YPS3Q12303 508 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W JLP1Q12358 412 aa3.5□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W PAN1P32521 1480 aa3.49□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W CUP2P15315 225 aa3.49□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YPK2P18961 677 aa3.49□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W ADO1P47143 340 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W DCN1Q12395 269 aa3.49□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W HTB1P02293 131 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W HTB2P02294 131 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W SNA3P14359 133 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YAK1P14680 807 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W PPH21P23594 369 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W TAF14P35189 244 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W CAB3P36076 571 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YJL028WP47062 111 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W MGA1P53050 456 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YGL034CP53186 121 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YOR186WQ08560 144 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YPL264CQ08980 353 aa3.48□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W PRX1P34227 261 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W SSH1P38353 490 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YRB2P40517 327 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W MCM22P47167 239 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W NUP57P48837 541 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W RSM27P53305 110 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W FYV6P53913 173 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YNL046WP53956 172 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YPR172WQ06608 200 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YPR011CQ12251 326 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W IES3Q12345 250 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YBL112CQ3E7Y4 105 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YKR047WYKR047W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SPT3P06844 337 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W TRM7P38238 310 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W TRR2P38816 342 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SPL2P38839 148 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SUR2P38992 349 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YJR149WP47177 404 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W FLC3P53121 802 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W ECM11Q04110 302 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W EMI1Q04406 187 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YOL019WQ08157 551 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W TPO4Q12256 659 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W TIM22Q12328 207 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SWI1P09547 1314 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W URA6P15700 204 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W BMH1P29311 267 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W MID2P36027 376 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SNZ1Q03148 297 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SLD7Q08457 257 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W PRR2Q12310 699 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W ISD11Q6Q560 94 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W RAD9P14737 1309 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SOD1P00445 154 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W APA2P22108 325 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W RFA3P26755 122 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W IKI1P38874 309 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W TEM1P38987 245 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W GET1P53192 235 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.44□□□□□ -1.86 RIP-Chip
YKR047WYKR047W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.7 ms