RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	PET18	P25362	215 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	MCM10	P32354	571 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	APD1	P38281	316 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SLZ1	P40167	298 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	IDP2	P41939	412 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	OTU1	P43558	301 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	CIN2	P46670	268 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	BXI1	P48558	297 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	HNT2	P49775	206 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	NIT3	P49954	291 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	BSC5	P53755	489 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	NRK1	P53915	240 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	HEM25	Q07534	307 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YOR376W	Q08900	122 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	FEX2	Q08991	375 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SRL2	Q12020	392 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	FRE7	Q12333	620 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YRM1	Q12340	786 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	RRI1	Q12468	440 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SCEI	P03882	235 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PHO2	P07269	559 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	CHO1	P08456	276 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PRB1	P09232	635 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	DAL82	P21705	255 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	COS9	P36034	407 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	MRPL36	P36531	177 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	UMP1	P38293	148 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	REE1	P40893	198 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	AAH1	P53909	347 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	KAP120	Q02932	1032 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	GIS1	Q03833	894 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YDR102C	Q03864	110 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YOR385W	Q08909	290 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	AKR2	Q12013	749 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	NAM2	P11325	894 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PDX1	P16451	410 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ERG8	P24521	451 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MTC7	P32633	139 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YBL010C	P32788	280 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	NAT2	P37293	288 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	NUP53	Q03790	475 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MIX14	Q04341	121 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MDM30	Q05930	598 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MCH4	Q08268	501 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YCR061W	P25639	631 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YKL069W	P36088	180 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	GEP4	P38812	185 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PUG1	P40100	303 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YJL016W	P47072	561 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PGU1	P47180	361 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	RNH201	P53942	307 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ATG21	Q02887	496 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	SDC1	Q03323	175 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YML018C	Q03730	393 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	ERP4	Q12450	207 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YLR358C	O13565	187 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	AAC1	P04710	309 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	HNM1	P19807	563 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MRP20	P32387	263 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	SUA5	P32579	426 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	OM14	P38325	134 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
MIA40	YKL195W	BUD8	P41698	603 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
MIA40	YKL195W	TRS23	Q03784	219 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	DLT1	Q04216	342 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	PUT1	P09368	476 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MIA40	YKL195W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49

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