RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	MGA1	P53050	456 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	NIF3	P53081	288 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	YGL034C	P53186	121 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	SEI1	Q06058	285 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	DCN1	Q12395	269 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL028W	YJL028W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	HTB2	P02294	131 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	SNA3	P14359	133 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	CSG2	P35206	410 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	MRPL39	P36533	70 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YHI9	P38765	294 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	BDH1	P39714	382 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	FRT2	P39734	528 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RPE1	P46969	238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	MRH4	P53166	561 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	SCW10	Q04951	389 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	JLP1	Q12358	412 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RAD9	P14737	1309 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	AUS1	Q08409	1394 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	QCR6	P00127	147 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	SPT3	P06844	337 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
YJL028W	YJL028W	YHL044W	P38727	235 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	OSH6	Q02201	448 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	NNT1	Q05874	261 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	PIN3	Q06449	215 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YOR186W	Q08560	144 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	PPH21	P23594	369 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RAD51	P25454	400 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	LDB16	P25587	256 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	CAB3	P36076	571 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	IKI1	P38874	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	MCM22	P47167	239 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	NUP57	P48837	541 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	COQ5	P49017	307 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	TOS8	P53147	276 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YNL046W	P53956	172 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	HEM25	Q07534	307 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	TPO4	Q12256	659 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YPS3	Q12303	508 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	SEO1	P39709	593 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	FYV6	P53913	173 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	GOT1	Q03554	138 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	TVP15	Q03860	143 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	QCR7	P00128	127 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	URA6	P15700	204 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	CPT1	P17898	393 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	ERD2	P18414	219 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	ADE1	P27616	306 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	SRY1	P36007	326 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	GET1	P53192	235 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YGR067C	P53243	804 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	EMI1	Q04406	187 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YPR011C	Q12251	326 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	TUS1	Q06412	1307 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YFL012W	P43580	148 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YJL028W	P47062	111 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	BRR6	P53062	197 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	MRX8	Q05473	314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	MSA1	Q08471	629 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	TIM22	Q12328	207 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	SWI1	P09547	1314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	PAN1	P32521	1480 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	CKA2	P19454	339 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YOX1	P34161	385 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	OST3	P48439	350 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	CDD1	Q06549	142 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL028W	YJL028W	COX5A	P00424	153 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YAK1	P14680	807 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	DBF2	P22204	572 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	MRPS9	P38120	278 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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