RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	ERD2	P18414	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	CDC43	P18898	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	SEC22	P22214	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	TRX3	P25372	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	SLM6	P38343	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	NVJ1	P38881	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YGR201C	P42936	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YNL046W	P53956	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	CRZ1	P53968	678 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	AIM34	Q03673	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	TIM44	Q01852	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	CYC3	P06182	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	STE7	P06784	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	PEX17	P40155	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YNL184C	P53876	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	HSK3	P69852	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	LIP2	Q06005	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	BBP1	Q12365	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MHP1	P43638	1398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	PHO2	P07269	559 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YCR025C	P25352	136 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YIL067C	P40514	678 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	UFE1	P41834	346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	EGT2	P42835	1041 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	COG7	P53195	279 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	RSC9	Q03124	581 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	MSA1	Q08471	629 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATG7	YHR171W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	PCI8	P40512	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SHY1	P53266	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SWP1	Q02795	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YOR1	P53049	1477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	TRS65	P32893	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	OMA1	P36163	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SOL2	P37262	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	AIM25	P47140	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	MRH4	P53166	561 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	PRM8	P53174	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	DYN2	Q02647	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	ATP16	Q12165	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	TRM10	Q12400	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	PEX11	Q12462	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	APS1	P35181	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	AVT7	P40501	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SUN4	P53616	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	FDH1	Q08911	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SWI1	P09547	1314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	MRS3	P10566	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	MRPL39	P36533	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	ARN2	P38724	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SEN34	P39707	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	CFD1	P40558	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	APS3	P47064	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YGL034C	P53186	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	FLO5	P38894	1075 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	FAR7	P43592	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	HST4	P53688	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	EPT1	P22140	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	URA10	P30402	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	OAR1	P35731	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms