RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W YKL107WP34251 309 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YFL051CP43552 160 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YJL016WP47072 561 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CTF19Q02732 369 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YDR248CQ03786 193 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W PIN3Q06449 215 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YBL029C-AQ3E756 94 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W IRA2P19158 3079 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CDC28P00546 298 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W PHO4P07270 312 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CNE1P27825 502 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W PEX4P29340 183 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W DBF20P32328 564 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YOX1P34161 385 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MCH2P36032 473 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CCS1P40202 249 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W TIR3P40552 269 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SER2P42941 309 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SSN8P47821 323 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CRZ1P53968 678 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YMR279CQ03263 540 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W UPS1Q05776 175 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W TPO3Q06451 622 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YPL199CQ08954 240 aa3.54□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W URA3P03962 267 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W SAG1P20840 650 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W PET18P25362 215 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ZRT3P34240 503 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W OST1P41543 476 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W BUD8P41698 603 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ABM1P47146 123 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W XPT1P47165 209 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ERV29P53337 310 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W RNH201P53942 307 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W ATG41Q12048 136 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.53□□□□□ -1.84not detected
SPC105YGL093W RPS31P05759 152 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CAP2P13517 287 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W UMP1P38293 148 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W IRC18P47056 224 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W GPI14P47088 403 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W UBC13P52490 153 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W UFD1P53044 361 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W MRH4P53166 561 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W WHI5Q12416 295 aa3.53□□□□□ -1.84
SPC105YGL093W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W FUR4P05316 633 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W GLC7P32598 312 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W MIA40P36046 403 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W BMT5P40493 336 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W MRX5P47007 382 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W TYW3P53177 273 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W KEI1Q06346 221 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YOR385WQ08909 290 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W ADK1P07170 222 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W PET54P10834 293 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W DAL80P26343 269 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SHM2P37291 469 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W NAT2P37293 288 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W PRS2P38620 318 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YHK8P38776 514 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W TAF4P50105 388 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W ASI3P53983 676 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SKO1Q02100 647 aa3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W URA6P15700 204 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W CPR4P25334 318 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W VMA3P25515 160 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YJR120WP47157 116 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W DIE2P50076 525 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W YIP4P53093 235 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W LIP2Q06005 328 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W GAT3Q07928 141 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W INP53Q12271 1107 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W GAL1P04385 528 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W AAC1P04710 309 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W CDC23P16522 626 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W ACH1P32316 526 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W MRPL3P36516 390 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W PAC2P39937 518 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W FLX1P40464 311 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.51□□□□□ -1.85not detected
SPC105YGL093W GWT1P47026 490 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W GPG1P53130 126 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W GEP7P53171 287 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W VHT1P53241 593 aa3.51□□□□□ -1.85
SPC105YGL093W LSM7P53905 115 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.5 ms