RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	SLZ1	P40167	298 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YJR120W	P47157	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	PMT5	P52867	743 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	ALG12	P53730	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	SRL4	Q03085	281 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	RSM28	Q03430	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	MGR3	Q04472	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	MED2	Q12124	431 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	MCT1	Q12283	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	CYC7	P00045	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	QCR7	P00128	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	COX5B	P00425	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	REP1	P03871	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	PRB1	P09232	635 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	PAU2	P32612	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	CCZ1	P38273	704 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YER084W	P40057	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	IDP2	P41939	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YFL051C	P43552	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YIP4	P53093	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	TYW3	P53177	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	TNA1	P53322	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	CRR1	Q05790	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	MED7	Q08278	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	COX17	Q12287	69 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	SOD2	P00447	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	HIS3	P06633	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	MTH1	P35198	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	SPT10	P35208	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	FRM2	P37261	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YHK8	P38776	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	TIR3	P40552	269 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	LOH1	P47055	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	PHB2	P50085	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	DOC1	P53068	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YNL092W	P53934	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	SAM50	P53969	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	YLR152C	P54072	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	HHT1	P61830	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	RCE1	Q03530	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	GPI17	Q04080	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	ASR1	Q06834	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	SSK1	Q07084	712 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	HEM25	Q07534	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	PEX27	Q08580	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	ATG41	Q12048	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	MSH5	Q12175	901 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	IZH2	Q12442	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	RRI1	Q12468	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP4	YHR069C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	GCN4	P03069	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SFK1	P35735	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	PEX7	P39108	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	TOK1	P40310	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CIN2	P46670	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CTK2	P46962	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MRH4	P53166	561 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	GPN3	Q06543	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	ISA2	Q12425	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RTN2	Q12443	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RPN13	O13563	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CLB2	P24869	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CLG1	P35190	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
RRP4	YHR069C	YBR096W	P38256	230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YBR137W	P38276	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	FCY21	P40039	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	BUD8	P41698	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MOB2	P43563	287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	BNA6	P43619	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MTM1	P53320	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	AAH1	P53909	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CIK1	Q01649	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.6 ms