RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF2	YGR129W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	TCA17	P32613	152 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	CUE1	P38428	203 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YHR218W	P38899	603 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	STB1	P42845	420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YGL101W	P53144	215 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RRN9	P53437	365 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	NUP49	Q02199	472 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	AIM36	Q03798	255 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	SIR3	P06701	978 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	MTH1	P35198	433 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RIB1	P38066	345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RMD6	P39975	231 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	SIT1	P39980	628 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YGR168C	P53293	376 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YNL033W	P53964	284 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YNL019C	P53975	284 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	UGO1	Q03327	502 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	ARR2	Q06597	130 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	SIR2	P06700	562 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	STE18	P18852	110 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	CMK2	P22517	447 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	PEX3	P28795	441 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	ATP7	P30902	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	FIP1	P45976	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	GSH2	Q08220	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	FRE5	Q08908	694 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	REC114	P32841	428 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	CTF8	P38877	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	GON7	P46984	123 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YGL114W	P53134	725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	GPI11	Q06636	219 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	GEP3	Q08622	556 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RPC34	P32910	317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RTC2	P38279	296 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	CIN2	P46670	268 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	CTK2	P46962	323 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YJL016W	P47072	561 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	AVT4	P50944	713 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	MTL1	P53214	551 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	HHT1	P61830	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	SGA1	P08019	549 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	SNF6	P18888	332 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	PRE4	P30657	266 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RFC3	P38629	340 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	PUG1	P40100	303 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RPA43	P46669	326 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	GPI8	P49018	411 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	TAF4	P50105	388 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	GET1	P53192	235 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	CAC2	Q04199	468 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	NFI1	Q12216	726 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF2	YGR129W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	LTV1	P34078	463 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	PIR5	P46999	287 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	XPT1	P47165	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	USE1	P53146	245 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YNR048W	P53740	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SWA2	Q06677	668 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SOR2	Q07786	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SAG1	P20840	650 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	NTG1	P31378	399 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	REC104	P33323	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	DDI1	P40087	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	GPI1	P53306	609 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SPR6	Q01684	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	PEX12	Q04370	399 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SPG4	Q04438	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	RFU1	Q08003	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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