RNA–Protein interactions for RNA: YOR054C

VHS3, Transcript of Negative regulatory subunit of protein phosphatase 1 Ppz1p, yeast

Gene VHS3, Length 2,025 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS3	YOR054C	MSC3	Q05812	728 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ATG5	Q12380	294 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	FRE6	Q12473	712 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	VPS13	Q07878	3144 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	GAL4	P04386	881 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	HIP1	P06775	603 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RIP1	P08067	215 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	HOP1	P20050	605 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PPH21	P23594	369 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	VBA3	P25594	458 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SHE1	P38200	338 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	VPS52	P39904	641 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	HAT2	P39984	401 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	LRO1	P40345	661 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	NEO1	P40527	1151 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	MEP2	P41948	499 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	QRI7	P43122	407 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SHY1	P53266	389 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	VPS28	Q02767	242 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	GOT1	Q03554	138 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	GMC1	Q04399	608 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	BLS1	Q06071	122 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YLR455W	Q06188	304 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CRD1	Q07560	283 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	LDB18	Q07887	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TEN1	Q07921	160 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CSI2	Q08054	341 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CSM4	Q08955	156 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ERP3	Q12403	225 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	FSH3	Q99369	266 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	COX2	P00410	251 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	COX5B	P00425	151 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CDC9	P04819	755 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	AGP1	P25376	633 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	MTH1	P35198	433 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YKL075C	P36083	450 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	DBP8	P38719	431 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	CTF8	P38877	133 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	OPT1	P40897	799 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PFD1	P46988	109 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	GWT1	P47026	490 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	IBA57	P47158	497 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RTT102	P53330	157 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YNR066C	P53752	436 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RSM10	Q03201	203 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ECM7	Q06200	448 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YPR127W	Q06494	345 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TRM13	Q12383	476 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	STT4	P37297	1900 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RAS1	P01119	309 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PBN1	P25580	416 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	MET22	P32179	357 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	OMA1	P36163	345 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	MRP21	P38175	177 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	POP8	P38208	133 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YBR220C	P38318	560 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ARP1	P38696	384 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	BDH1	P39714	382 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YEL028W	P39989	153 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YER188W	P40103	239 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YIL152W	P40455	235 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	SYS1	P41544	203 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PMT6	P42934	759 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	ASK10	P48361	1146 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	IRC15	Q02733	499 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	NAT4	Q04751	285 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YDR286C	Q05530	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	KEI1	Q06346	221 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	REX4	Q08237	289 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	IES4	Q08561	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YOR378W	Q08902	515 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	YDL176W	Q12027	708 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	PET20	Q99373	253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VHS3	YOR054C	APE1	P14904	514 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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