RNA–Protein interactions for RNA: YML014W

TRM9, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM9, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM9	YML014W	PRB1	P09232	635 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	STS1	P38637	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	AIM20	P40451	204 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	AAD14	P42884	376 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	RPA14	P50106	137 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	YKR005C	Q02203	525 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	YMR130W	Q04223	302 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	DBF2	P22204	572 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	RCN1	P36054	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	YJR120W	P47157	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	SLI1	P53304	468 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	ERV29	P53337	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	GAS2	Q06135	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	PEX30	Q06169	523 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	TGS1	Q12052	315 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	KRE6	P32486	720 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	FRM2	P37261	193 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	YBR096W	P38256	230 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	DLS1	P40366	167 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	TIR3	P40552	269 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	RPN14	P53196	417 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	SAM50	P53969	484 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	ATG41	Q12048	136 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	NAM2	P11325	894 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	MRPL39	P36533	70 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	PUG1	P40100	303 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	LOH1	P47055	219 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	PCP1	P53259	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	YNL165W	P53891	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	ASI3	P53983	676 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	PLB2	Q03674	706 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	TPO3	Q06451	622 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	SSK1	Q07084	712 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	FRE3	Q08905	711 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	MSS4	P38994	779 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	TPN1	P53099	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	YDR387C	Q04162	555 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	YDL180W	Q12301	547 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRM9	YML014W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	RIB7	P33312	244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	HPA3	P39979	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	SCY1	P53009	804 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	COQ11	Q05892	277 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	CNE1	P27825	502 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	PRE4	P30657	266 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	SNC2	P33328	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	YGL260W	P53056	76 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	POP6	P53218	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	NRK1	P53915	240 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	SEC66	P33754	206 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	SYS1	P41544	203 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	YNR040W	P53736	256 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	AAH1	P53909	347 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	RSM23	Q01163	450 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	YAP6	Q03935	383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	YLR352W	Q06479	807 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	YDL218W	Q07629	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	ORT1	Q12375	292 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	PHO2	P07269	559 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	SED4	P25365	1065 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	HYM1	P32464	399 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	MKS1	P34072	584 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	CLG1	P35190	452 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	ASR1	Q06834	288 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	RAF1	Q06891	181 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	NUM1	Q00402	2748 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	PPG1	P32838	368 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	XBP1	P40489	647 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	MRP51	Q02950	344 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	MCT1	Q12283	360 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRM9	YML014W	COX5B	P00425	151 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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