RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN3	YKL125W	SNF8	Q12483	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	CYC7	P00045	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ERS1	P17261	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PUG1	P40100	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SYS1	P41544	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MOB2	P43563	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RMD8	P43620	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YJL163C	P46996	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ZAP1	P47043	880 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	HNT2	P49775	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PRM8	P53174	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	NUP100	Q02629	959 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	HRD3	Q05787	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	BSP1	Q06604	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MDY2	Q12285	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PST1	Q12355	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	JLP1	Q12358	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	BOS1	P25385	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RML2	P32611	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SFK1	P35735	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	BNA4	P38169	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	GPI16	P38875	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	KHA1	P40309	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PHB2	P50085	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ARG7	Q04728	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RRN3	YKL125W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RKI1	Q12189	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	FRE8	Q12209	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SIA1	Q12212	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SKS1	Q12505	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PRE8	P23639	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MSK1	P32048	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	QDR3	P38227	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SPO73	P40031	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	FMC1	P40491	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MTL1	P53214	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	CUZ1	P53899	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	AAH1	P53909	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MSC2	Q03455	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YML018C	Q03730	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PIN3	Q06449	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	NAT5	Q08689	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MMT2	Q08970	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	NUS1	Q12063	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ISA2	Q12425	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RRI1	Q12468	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SAL1	D6W196	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	RIP1	P08067	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	APE1	P14904	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ADH7	P25377	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MRP17	P28778	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	STE14	P32584	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	TMT1	P32643	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ASK1	P35734	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
RRN3	YKL125W	RIB5	P38145	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	WSS1	P38838	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	MET30	P39014	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YER121W	P40076	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	PAU15	P40585	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	BUD9	P53226	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	GTR2	P53290	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	SPP2	Q02521	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	DYN2	Q02647	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	GTO3	Q04806	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3	YKL125W	ROY1	Q04847	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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