RNA–Protein interactions for RNA: YDR119W

VBA4, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene VBA4, Length 2,307 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA4YDR119W GRX8Q05926 109 aa2.79□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W ORM2Q06144 216 aa2.79□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W MMT2Q08970 484 aa2.79□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W IFM1P25038 676 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W AVT5P38176 459 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W CYC2P38909 366 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W AVT4P50944 713 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W TPN1P53099 579 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W PDR17P53844 350 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W SWS2P53937 143 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W TAF9Q05027 157 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W INM2Q05533 292 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W PEX30Q06169 523 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W BSC1Q12140 328 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W PRM4Q12498 284 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa2.78□□□□□ -1.96
VBA4YDR119W PET54P10834 293 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MRPL3P36516 390 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MTC6P38849 526 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W EDC3P39998 551 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YLR446WQ06204 433 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YLR112WQ12130 139 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W PCL9Q12477 304 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YOL163WP0CF20 169 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W CDC43P18898 376 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.77□□□□□ -1.97not detected
VBA4YDR119W MRPL28P36527 147 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W OPY1P38271 328 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W GOS1P38736 223 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MOG1P47123 218 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MCM22P47167 239 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W NBP35P52920 328 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YMR181CQ03231 154 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YMR279CQ03263 540 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YET2Q04210 160 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W GMC1Q04399 608 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W COQ10Q08058 207 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W SLM3Q12093 417 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W FRE8Q12209 686 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W AGC1Q12482 902 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W BI3Q9ZZW7 517 aa2.77□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YAL064W-BO13512 126 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W CUP2P15315 225 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W PHA2P32452 334 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W CLG1P35190 452 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W SER33P40510 469 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W RRT5P43607 289 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YJR054WP47114 497 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W COS6P53344 381 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YMR010WQ03687 405 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W ARO80Q04052 950 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W FCY22Q12119 530 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W RFM1Q12192 310 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MCT1Q12283 360 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W TUB1P09733 447 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MGT1P26188 188 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W AGA1P32323 725 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W UPS2P35200 230 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W COX14P39103 70 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YER076CP40049 302 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W GAT1P43574 510 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W SCS7Q03529 384 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YPR127WQ06494 345 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YLR036CQ07986 203 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W IRC10Q08118 586 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W SFM1Q12314 213 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MRX4Q12467 430 aa2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W COX5AP00424 153 aa2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W HEM4P06174 275 aa2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W DBF2P22204 572 aa2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W UBC8P28263 218 aa2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W TIP20P33891 701 aa2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W ECM33P38248 429 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W MDM31P38880 579 aa2.75□□□□□ -1.97
VBA4YDR119W COS4P43542 379 aa2.75□□□□□ -1.97
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