RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	OST6	Q03723	332 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	EKI1	Q03764	534 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	RDR1	Q08904	546 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CPR4	YCR069W	PDX1	P16451	410 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SPO7	P18410	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	UTR1	P21373	530 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YCK1	P23291	538 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	ERG8	P24521	451 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	STE50	P25344	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MBA1	P38300	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	APE4	P38821	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YHR180W	P38868	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PCL6	P40038	420 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	FCY21	P40039	528 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SER3	P40054	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CIN1	P40987	1014 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	GDS1	P41913	522 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	GSH2	Q08220	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MED2	Q12124	431 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	BAG7	Q12128	409 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	FRE6	Q12473	712 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MTR10	Q99189	972 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MSW1	P04803	379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YPK2	P18961	677 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YCR100C	P25606	316 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	NDC1	P32500	655 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	DOA4	P32571	926 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MDL1	P33310	695 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SDS22	P36047	338 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	DTR1	P38125	572 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MNN5	P46982	586 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SFH5	P47008	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MTM1	P53320	366 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PAU12	P53343	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MKC7	P53379	596 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YNR062C	P53748	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PGA1	P53896	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YNL092W	P53934	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SNX41	Q04053	625 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MGR3	Q04472	501 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	TPO3	Q06451	622 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	GPN3	Q06543	272 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CYK3	Q07533	885 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RAX1	Q08760	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CRC1	Q12289	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RRI1	Q12468	440 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	TMA17	Q12513	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SCEI	P03882	235 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	NAM2	P11325	894 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SCO1	P23833	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RAD51	P25454	400 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SEF1	P34228	1148 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
CPR4	YCR069W	GPX2	P38143	162 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MAL32	P38158	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SHE1	P38200	338 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SDH8	P38345	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PHO90	P39535	881 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YER010C	P40011	234 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RPE1	P46969	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PGU1	P47180	361 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MAL12	P53341	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MRPL19	P53875	158 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SCS7	Q03529	384 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	INP1	Q03694	420 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	NUP53	Q03790	475 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	AIM6	Q07716	390 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	URA3	P03962	267 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76

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