RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YPR172W	Q06608	200 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	MHR1	Q06630	226 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	TMS1	Q12116	473 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	ERV2	Q12284	196 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	BLM10	P43583	2143 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RIP1	P08067	215 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	HOM3	P10869	527 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RHB1	P25378	209 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	PMT2	P31382	759 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YOR062C	P36025	268 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RSM22	P36056	628 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	ECM8	P38246	354 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RCY1	P39531	840 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	SPO73	P40031	143 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	COG3	P40094	801 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	TOS2	P50078	622 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	PRM8	P53174	237 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YGR067C	P53243	804 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	SWP1	Q02795	286 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	INP1	Q03694	420 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RNH202	Q05635	350 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	GLE1	Q12315	538 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RIB3	Q99258	208 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	KSS1	P14681	368 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	FAR1	P21268	830 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YBR285W	P38354	144 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	ECM34	P38728	170 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	APS3	P47064	194 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	NUP57	P48837	541 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YDR541C	Q03049	344 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	NFI1	Q12216	726 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	PBN1	P25580	416 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	AVT4	P50944	713 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YGR168C	P53293	376 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	PEX25	Q02969	394 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	SMP3	Q04174	516 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	ARV1	Q06541	321 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	REX3	Q12090	404 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	PSF1	Q12488	208 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	MHF1	Q3E835	90 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	TPK3	P05986	398 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	CPR4	P25334	318 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	LSB5	P25369	354 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	ITR2	P30606	609 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	HIR2	P32480	875 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	SEF1	P34228	1148 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	NAT2	P37293	288 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	CUP9	P41817	306 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	HMS2	P47175	358 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	COG5	P53951	403 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	YLR460C	P54007	376 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	NCE101	Q02820	53 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	URC2	Q04411	772 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	AKR2	Q12013	749 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	TPO4	Q12256	659 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SLX1	YBR228W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	YCR100C	P25606	316 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	NSG1	P38837	291 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	TDA11	P38854	504 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	PEX18	P38855	283 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ALP1	P38971	573 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SLX1	YBR228W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83

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