RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	GPI18	P38211	433 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	FAT1	P38225	669 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YBR096W	P38256	230 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	HPM1	P40481	377 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SHE9	Q04172	456 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YPR196W	Q06595	470 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YPT6	Q99260	215 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	COX5B	P00425	151 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ATP6	P00854	259 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MSW1	P04803	379 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MRPL33	P20084	86 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	VMA3	P25515	160 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MIG1	P27705	504 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ACH1	P32316	526 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	IES6	P32617	166 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MRE11	P32829	692 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	FIG1	P38224	298 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SLM1	P40485	686 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	TDA10	P42938	290 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	EXG2	P52911	562 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	TYW3	P53177	273 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RRN5	Q02983	363 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	HSP31	Q04432	237 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YDR114C	Q04597	100 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MED7	Q08278	222 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	APC2	Q12440	853 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	SIR3	P06701	978 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	MRPS28	P21771	286 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	CSM1	P25651	190 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	IRC5	P43610	853 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	WSC2	P53832	503 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	YDC1	Q02896	317 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	HFD1	Q04458	532 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	DYN3	Q04949	312 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	THP1	Q08231	455 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL057W	YNL057W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.65	□□□□□ -1.83	not detected
YNL057W	YNL057W	TOA1	P32773	286 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YME2	P32843	850 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MCH2	P36032	473 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	ALP1	P38971	573 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RCY1	P39531	840 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MPM1	P40364	252 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PMT6	P42934	759 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	UFD1	P53044	361 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	COX18	P53239	316 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	NUP49	Q02199	472 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	NNT1	Q05874	261 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YDL114W	Q07530	308 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MCH4	Q08268	501 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	FCY22	Q12119	530 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SPC3	Q12133	184 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	ACF2	Q12168	779 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	OPI3	P05375	206 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	STE18	P18852	110 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	STE50	P25344	346 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PEX3	P28795	441 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	DGR2	P32330	852 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YBR241C	P38142	488 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	PEX32	P38292	413 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MLH1	P38920	769 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YER184C	P39961	794 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SSY5	P47002	699 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	LOH1	P47055	219 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	MDE1	P47095	244 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SAM37	P50110	327 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	COG2	P53271	262 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RRN9	P53437	365 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RNH201	P53942	307 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	RSM23	Q01163	450 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	GPI17	Q04080	534 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	SWA2	Q06677	668 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL057W	YNL057W	YOR029W	Q12243	111 aa		3.64	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms