RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	BRR6	P53062	197 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DOC1	P53068	250 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	EMC4	P53073	190 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YGR015C	P53208	328 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SWS2	P53937	143 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GMC1	Q04399	608 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	JLP1	Q12358	412 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TRX3	P25372	127 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	AGP1	P25376	633 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	VPS17	P32913	551 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ALY1	P36117	915 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PAU24	P38155	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SUR2	P38992	349 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	NSE4	P43124	402 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MAL12	P53341	584 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	EAF3	Q12432	401 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	IMG1	P25626	169 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MET22	P32179	357 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SPT14	P32363	452 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SOL2	P37262	315 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TRR2	P38816	342 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	AIM46	P38885	310 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GTT1	P40582	234 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	AMA1	P50082	593 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YGR012W	P53206	393 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	BUD9	P53226	547 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DAD3	P69850	94 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YML096W	Q04489	525 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YOR365C	Q08844	703 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GPI12	P23797	304 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GPX1	P36014	167 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DCW1	P36091	449 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PIG2	P40187	538 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TAF4	P50105	388 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	HCH1	P53834	153 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GPB1	Q08886	897 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	AKR2	Q12013	749 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CDC9	P04819	755 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RHB1	P25378	209 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DBF20	P32328	564 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DAD2	P36162	133 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TAT1	P38085	619 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YDL183C	P48569	320 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MUP1	P50276	574 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	POP6	P53218	158 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	REX4	Q08237	289 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SUL2	Q12325	893 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ODC2	Q99297	307 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	HIP1	P06775	603 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CHS7	P38843	316 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ZIM17	P42844	174 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	UBC12	P52491	188 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YGR026W	P53217	278 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YAP1802	P53309	568 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MTQ1	P53944	314 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SPR6	Q01684	191 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SKO1	Q02100	647 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YPL039W	Q03080	316 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MRX8	Q05473	314 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SCP1	Q08873	200 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SPC3	Q12133	184 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	WSC3	Q12215	556 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	FYV7	Q12247	151 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DCN1	Q12395	269 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PET54	P10834	293 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SFK1	P35735	353 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RIB1	P38066	345 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	IML3	P38265	245 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PTC7	P38797	343 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YHR177W	P38867	453 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SGF73	P53165	657 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SNO2	P53823	222 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	IRC19	Q07843	230 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GEX1	P25596	615 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	THI4	P32318	326 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GEX2	P36173	615 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPE1	P46969	238 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PHO23	P50947	330 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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